Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFNB1P01574 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFNB1P01574 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFNB1P01574 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFNB1P01574 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFNB1P01574 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFNB1P01574 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
IFNB1P01574 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IFNB1P01574 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
IFNB1P01574 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IFNB1P01574 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IFNB1P01574 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
IFNB1P01574 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
IFNB1P01574 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IFNB1P01574 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
IFNB1P01574 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IFNB1P01574 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IFNB1P01574 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IFNB1P01574 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFNB1P01574 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFNB1P01574 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
IFNB1P01574 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFNB1P01574 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFNB1P01574 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IFNB1P01574 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IFNB1P01574 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IFNB1P01574 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IFNB1P01574 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IFNB1P01574 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
IFNB1P01574 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IFNB1P01574 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IFNB1P01574 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IFNB1P01574 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
IFNB1P01574 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
IFNB1P01574 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
IFNB1P01574 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
IFNB1P01574 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
IFNB1P01574 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
IFNB1P01574 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
IFNB1P01574 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
IFNB1P01574 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
IFNB1P01574 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
IFNB1P01574 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IFNB1P01574 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IFNB1P01574 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IFNB1P01574 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
IFNB1P01574 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
IFNB1P01574 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
IFNB1P01574 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
IFNB1P01574 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IFNB1P01574 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IFNB1P01574 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
IFNB1P01574 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
IFNB1P01574 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
IFNB1P01574 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
IFNB1P01574 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
IFNB1P01574 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IFNB1P01574 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
IFNB1P01574 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IFNB1P01574 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IFNB1P01574 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
IFNB1P01574 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
IFNB1P01574 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
IFNB1P01574 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IFNB1P01574 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IFNB1P01574 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IFNB1P01574 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IFNB1P01574 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IFNB1P01574 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IFNB1P01574 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
IFNB1P01574 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IFNB1P01574 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
IFNB1P01574 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IFNB1P01574 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IFNB1P01574 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IFNB1P01574 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IFNB1P01574 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
IFNB1P01574 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
IFNB1P01574 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
IFNB1P01574 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
IFNB1P01574 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IFNB1P01574 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IFNB1P01574 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
IFNB1P01574 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IFNB1P01574 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IFNB1P01574 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IFNB1P01574 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IFNB1P01574 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
IFNB1P01574 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
IFNB1P01574 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
IFNB1P01574 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
IFNB1P01574 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IFNB1P01574 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IFNB1P01574 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
IFNB1P01574 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IFNB1P01574 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
IFNB1P01574 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
IFNB1P01574 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFNB1P01574 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFNB1P01574 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms