Protein–RNA interactions for Protein: P00746

CFD, Complement factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP00746 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CFDP00746 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CFDP00746 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFDP00746 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFDP00746 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CFDP00746 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFDP00746 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFDP00746 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CFDP00746 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CFDP00746 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFDP00746 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFDP00746 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFDP00746 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CFDP00746 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFDP00746 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFDP00746 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CFDP00746 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFDP00746 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFDP00746 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CFDP00746 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFDP00746 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFDP00746 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CFDP00746 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFDP00746 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFDP00746 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CFDP00746 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CFDP00746 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CFDP00746 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CFDP00746 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CFDP00746 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CFDP00746 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CFDP00746 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFDP00746 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CFDP00746 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CFDP00746 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CFDP00746 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CFDP00746 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CFDP00746 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CFDP00746 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CFDP00746 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CFDP00746 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CFDP00746 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CFDP00746 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CFDP00746 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CFDP00746 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CFDP00746 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CFDP00746 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CFDP00746 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CFDP00746 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CFDP00746 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CFDP00746 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CFDP00746 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CFDP00746 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CFDP00746 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CFDP00746 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CFDP00746 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CFDP00746 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CFDP00746 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CFDP00746 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CFDP00746 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CFDP00746 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CFDP00746 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CFDP00746 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CFDP00746 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CFDP00746 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CFDP00746 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CFDP00746 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CFDP00746 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CFDP00746 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CFDP00746 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CFDP00746 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CFDP00746 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CFDP00746 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CFDP00746 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CFDP00746 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CFDP00746 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CFDP00746 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CFDP00746 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CFDP00746 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CFDP00746 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CFDP00746 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CFDP00746 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CFDP00746 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CFDP00746 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CFDP00746 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CFDP00746 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CFDP00746 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CFDP00746 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CFDP00746 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CFDP00746 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CFDP00746 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CFDP00746 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CFDP00746 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CFDP00746 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CFDP00746 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CFDP00746 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CFDP00746 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CFDP00746 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CFDP00746 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CFDP00746 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms