Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CBX6O95503 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CBX6O95503 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CBX6O95503 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CBX6O95503 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CBX6O95503 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CBX6O95503 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CBX6O95503 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CBX6O95503 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CBX6O95503 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CBX6O95503 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CBX6O95503 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CBX6O95503 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CBX6O95503 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CBX6O95503 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CBX6O95503 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CBX6O95503 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CBX6O95503 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CBX6O95503 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CBX6O95503 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CBX6O95503 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CBX6O95503 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CBX6O95503 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CBX6O95503 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CBX6O95503 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CBX6O95503 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CBX6O95503 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CBX6O95503 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CBX6O95503 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CBX6O95503 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CBX6O95503 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CBX6O95503 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CBX6O95503 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CBX6O95503 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CBX6O95503 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CBX6O95503 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CBX6O95503 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CBX6O95503 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CBX6O95503 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CBX6O95503 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CBX6O95503 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CBX6O95503 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CBX6O95503 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CBX6O95503 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CBX6O95503 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CBX6O95503 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CBX6O95503 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CBX6O95503 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CBX6O95503 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CBX6O95503 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CBX6O95503 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CBX6O95503 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CBX6O95503 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CBX6O95503 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CBX6O95503 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CBX6O95503 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CBX6O95503 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CBX6O95503 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CBX6O95503 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CBX6O95503 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CBX6O95503 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CBX6O95503 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CBX6O95503 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CBX6O95503 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CBX6O95503 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CBX6O95503 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CBX6O95503 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CBX6O95503 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CBX6O95503 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CBX6O95503 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CBX6O95503 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CBX6O95503 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CBX6O95503 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CBX6O95503 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CBX6O95503 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CBX6O95503 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CBX6O95503 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CBX6O95503 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CBX6O95503 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CBX6O95503 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CBX6O95503 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CBX6O95503 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CBX6O95503 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CBX6O95503 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CBX6O95503 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CBX6O95503 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CBX6O95503 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CBX6O95503 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CBX6O95503 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CBX6O95503 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CBX6O95503 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CBX6O95503 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CBX6O95503 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CBX6O95503 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CBX6O95503 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CBX6O95503 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CBX6O95503 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CBX6O95503 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CBX6O95503 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CBX6O95503 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms