Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBXN7O94888 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
UBXN7O94888 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBXN7O94888 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBXN7O94888 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBXN7O94888 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBXN7O94888 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBXN7O94888 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBXN7O94888 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBXN7O94888 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBXN7O94888 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBXN7O94888 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBXN7O94888 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBXN7O94888 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBXN7O94888 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBXN7O94888 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBXN7O94888 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBXN7O94888 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBXN7O94888 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBXN7O94888 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBXN7O94888 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBXN7O94888 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBXN7O94888 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBXN7O94888 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBXN7O94888 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBXN7O94888 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBXN7O94888 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBXN7O94888 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
UBXN7O94888 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBXN7O94888 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBXN7O94888 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBXN7O94888 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBXN7O94888 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBXN7O94888 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBXN7O94888 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBXN7O94888 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBXN7O94888 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
UBXN7O94888 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBXN7O94888 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBXN7O94888 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBXN7O94888 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBXN7O94888 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBXN7O94888 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBXN7O94888 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBXN7O94888 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBXN7O94888 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBXN7O94888 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBXN7O94888 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBXN7O94888 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBXN7O94888 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBXN7O94888 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN7O94888 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN7O94888 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN7O94888 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN7O94888 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN7O94888 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN7O94888 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN7O94888 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN7O94888 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN7O94888 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN7O94888 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN7O94888 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBXN7O94888 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBXN7O94888 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBXN7O94888 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBXN7O94888 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBXN7O94888 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBXN7O94888 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
UBXN7O94888 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBXN7O94888 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBXN7O94888 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBXN7O94888 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBXN7O94888 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBXN7O94888 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBXN7O94888 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBXN7O94888 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBXN7O94888 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBXN7O94888 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBXN7O94888 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBXN7O94888 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBXN7O94888 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBXN7O94888 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBXN7O94888 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBXN7O94888 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBXN7O94888 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBXN7O94888 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBXN7O94888 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBXN7O94888 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBXN7O94888 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBXN7O94888 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
UBXN7O94888 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBXN7O94888 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBXN7O94888 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBXN7O94888 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBXN7O94888 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBXN7O94888 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
UBXN7O94888 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBXN7O94888 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
UBXN7O94888 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBXN7O94888 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms