Protein–RNA interactions for Protein: O75368

SH3BGRL, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRLO75368 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH3BGRLO75368 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH3BGRLO75368 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH3BGRLO75368 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH3BGRLO75368 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH3BGRLO75368 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SH3BGRLO75368 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SH3BGRLO75368 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SH3BGRLO75368 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SH3BGRLO75368 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SH3BGRLO75368 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH3BGRLO75368 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH3BGRLO75368 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH3BGRLO75368 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH3BGRLO75368 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH3BGRLO75368 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH3BGRLO75368 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH3BGRLO75368 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH3BGRLO75368 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH3BGRLO75368 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH3BGRLO75368 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH3BGRLO75368 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH3BGRLO75368 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH3BGRLO75368 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH3BGRLO75368 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH3BGRLO75368 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SH3BGRLO75368 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SH3BGRLO75368 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SH3BGRLO75368 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SH3BGRLO75368 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SH3BGRLO75368 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SH3BGRLO75368 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SH3BGRLO75368 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SH3BGRLO75368 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SH3BGRLO75368 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SH3BGRLO75368 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SH3BGRLO75368 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SH3BGRLO75368 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH3BGRLO75368 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH3BGRLO75368 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH3BGRLO75368 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH3BGRLO75368 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH3BGRLO75368 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SH3BGRLO75368 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH3BGRLO75368 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH3BGRLO75368 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH3BGRLO75368 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH3BGRLO75368 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3BGRLO75368 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3BGRLO75368 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3BGRLO75368 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3BGRLO75368 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3BGRLO75368 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3BGRLO75368 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3BGRLO75368 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH3BGRLO75368 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH3BGRLO75368 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH3BGRLO75368 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3BGRLO75368 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3BGRLO75368 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3BGRLO75368 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3BGRLO75368 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3BGRLO75368 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3BGRLO75368 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3BGRLO75368 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3BGRLO75368 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3BGRLO75368 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3BGRLO75368 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3BGRLO75368 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3BGRLO75368 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3BGRLO75368 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3BGRLO75368 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3BGRLO75368 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3BGRLO75368 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3BGRLO75368 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3BGRLO75368 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3BGRLO75368 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3BGRLO75368 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3BGRLO75368 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3BGRLO75368 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3BGRLO75368 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3BGRLO75368 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3BGRLO75368 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3BGRLO75368 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3BGRLO75368 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3BGRLO75368 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3BGRLO75368 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3BGRLO75368 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3BGRLO75368 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3BGRLO75368 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3BGRLO75368 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3BGRLO75368 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3BGRLO75368 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3BGRLO75368 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3BGRLO75368 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3BGRLO75368 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3BGRLO75368 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SH3BGRLO75368 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3BGRLO75368 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3BGRLO75368 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms