Protein–RNA interactions for Protein: O60524

NEMF, Nuclear export mediator factor NEMF, humanhuman

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMFO60524 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEMFO60524 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEMFO60524 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEMFO60524 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEMFO60524 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEMFO60524 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEMFO60524 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEMFO60524 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEMFO60524 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
NEMFO60524 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEMFO60524 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
NEMFO60524 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEMFO60524 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEMFO60524 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEMFO60524 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
NEMFO60524 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEMFO60524 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEMFO60524 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEMFO60524 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEMFO60524 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
NEMFO60524 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEMFO60524 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEMFO60524 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEMFO60524 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEMFO60524 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NEMFO60524 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NEMFO60524 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NEMFO60524 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NEMFO60524 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NEMFO60524 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NEMFO60524 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NEMFO60524 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NEMFO60524 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NEMFO60524 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NEMFO60524 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NEMFO60524 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NEMFO60524 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NEMFO60524 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NEMFO60524 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NEMFO60524 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NEMFO60524 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NEMFO60524 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NEMFO60524 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
NEMFO60524 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NEMFO60524 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NEMFO60524 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NEMFO60524 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NEMFO60524 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NEMFO60524 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NEMFO60524 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NEMFO60524 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NEMFO60524 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NEMFO60524 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NEMFO60524 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NEMFO60524 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEMFO60524 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEMFO60524 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NEMFO60524 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NEMFO60524 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NEMFO60524 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NEMFO60524 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NEMFO60524 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEMFO60524 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEMFO60524 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEMFO60524 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEMFO60524 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEMFO60524 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
NEMFO60524 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEMFO60524 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NEMFO60524 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NEMFO60524 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NEMFO60524 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEMFO60524 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEMFO60524 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEMFO60524 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEMFO60524 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEMFO60524 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEMFO60524 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEMFO60524 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEMFO60524 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEMFO60524 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEMFO60524 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NEMFO60524 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEMFO60524 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEMFO60524 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEMFO60524 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEMFO60524 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEMFO60524 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEMFO60524 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEMFO60524 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEMFO60524 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEMFO60524 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEMFO60524 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEMFO60524 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEMFO60524 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEMFO60524 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEMFO60524 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEMFO60524 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEMFO60524 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEMFO60524 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms