Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MARCH6O60337 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MARCH6O60337 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MARCH6O60337 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MARCH6O60337 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MARCH6O60337 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
MARCH6O60337 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
MARCH6O60337 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MARCH6O60337 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
MARCH6O60337 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
MARCH6O60337 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MARCH6O60337 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MARCH6O60337 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MARCH6O60337 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MARCH6O60337 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MARCH6O60337 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MARCH6O60337 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
MARCH6O60337 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MARCH6O60337 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MARCH6O60337 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MARCH6O60337 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MARCH6O60337 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MARCH6O60337 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MARCH6O60337 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MARCH6O60337 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MARCH6O60337 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MARCH6O60337 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MARCH6O60337 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
MARCH6O60337 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MARCH6O60337 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MARCH6O60337 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MARCH6O60337 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MARCH6O60337 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
MARCH6O60337 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MARCH6O60337 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MARCH6O60337 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MARCH6O60337 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MARCH6O60337 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MARCH6O60337 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MARCH6O60337 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MARCH6O60337 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MARCH6O60337 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MARCH6O60337 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MARCH6O60337 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MARCH6O60337 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MARCH6O60337 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MARCH6O60337 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
MARCH6O60337 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MARCH6O60337 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MARCH6O60337 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
MARCH6O60337 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MARCH6O60337 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MARCH6O60337 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MARCH6O60337 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
MARCH6O60337 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
MARCH6O60337 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
MARCH6O60337 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MARCH6O60337 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MARCH6O60337 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
MARCH6O60337 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
MARCH6O60337 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MARCH6O60337 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
MARCH6O60337 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MARCH6O60337 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MARCH6O60337 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
MARCH6O60337 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MARCH6O60337 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MARCH6O60337 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MARCH6O60337 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MARCH6O60337 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MARCH6O60337 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MARCH6O60337 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MARCH6O60337 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MARCH6O60337 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MARCH6O60337 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MARCH6O60337 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MARCH6O60337 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MARCH6O60337 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MARCH6O60337 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MARCH6O60337 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MARCH6O60337 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MARCH6O60337 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MARCH6O60337 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MARCH6O60337 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MARCH6O60337 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MARCH6O60337 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MARCH6O60337 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MARCH6O60337 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MARCH6O60337 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MARCH6O60337 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MARCH6O60337 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MARCH6O60337 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MARCH6O60337 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MARCH6O60337 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
MARCH6O60337 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
MARCH6O60337 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
MARCH6O60337 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
MARCH6O60337 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
MARCH6O60337 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
MARCH6O60337 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms