Protein–RNA interactions for Protein: O60245

PCDH7, Protocadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH7O60245 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDH7O60245 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDH7O60245 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDH7O60245 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDH7O60245 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDH7O60245 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDH7O60245 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDH7O60245 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDH7O60245 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDH7O60245 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDH7O60245 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDH7O60245 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PCDH7O60245 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDH7O60245 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDH7O60245 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDH7O60245 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDH7O60245 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDH7O60245 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDH7O60245 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDH7O60245 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDH7O60245 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDH7O60245 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDH7O60245 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDH7O60245 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDH7O60245 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDH7O60245 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDH7O60245 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDH7O60245 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDH7O60245 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDH7O60245 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDH7O60245 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDH7O60245 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDH7O60245 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDH7O60245 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDH7O60245 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDH7O60245 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDH7O60245 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDH7O60245 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDH7O60245 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDH7O60245 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDH7O60245 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDH7O60245 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDH7O60245 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDH7O60245 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDH7O60245 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDH7O60245 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDH7O60245 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDH7O60245 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDH7O60245 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDH7O60245 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDH7O60245 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDH7O60245 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDH7O60245 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDH7O60245 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDH7O60245 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDH7O60245 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDH7O60245 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDH7O60245 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDH7O60245 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDH7O60245 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDH7O60245 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDH7O60245 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDH7O60245 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDH7O60245 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDH7O60245 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDH7O60245 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDH7O60245 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDH7O60245 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDH7O60245 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDH7O60245 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDH7O60245 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDH7O60245 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDH7O60245 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PCDH7O60245 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDH7O60245 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDH7O60245 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDH7O60245 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDH7O60245 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDH7O60245 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDH7O60245 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDH7O60245 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDH7O60245 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDH7O60245 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDH7O60245 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDH7O60245 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDH7O60245 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDH7O60245 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDH7O60245 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDH7O60245 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDH7O60245 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDH7O60245 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDH7O60245 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDH7O60245 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDH7O60245 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDH7O60245 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDH7O60245 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDH7O60245 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDH7O60245 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDH7O60245 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDH7O60245 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms