Protein–RNA interactions for Protein: O43711

TLX3, T-cell leukemia homeobox protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLX3O43711 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TLX3O43711 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TLX3O43711 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TLX3O43711 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TLX3O43711 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TLX3O43711 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TLX3O43711 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TLX3O43711 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TLX3O43711 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TLX3O43711 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TLX3O43711 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TLX3O43711 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TLX3O43711 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TLX3O43711 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TLX3O43711 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TLX3O43711 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TLX3O43711 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TLX3O43711 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TLX3O43711 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TLX3O43711 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TLX3O43711 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TLX3O43711 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TLX3O43711 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TLX3O43711 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TLX3O43711 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TLX3O43711 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TLX3O43711 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TLX3O43711 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TLX3O43711 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TLX3O43711 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TLX3O43711 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TLX3O43711 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TLX3O43711 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TLX3O43711 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TLX3O43711 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TLX3O43711 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TLX3O43711 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TLX3O43711 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TLX3O43711 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TLX3O43711 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TLX3O43711 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TLX3O43711 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TLX3O43711 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TLX3O43711 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TLX3O43711 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TLX3O43711 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TLX3O43711 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TLX3O43711 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TLX3O43711 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TLX3O43711 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TLX3O43711 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TLX3O43711 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TLX3O43711 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TLX3O43711 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TLX3O43711 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TLX3O43711 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TLX3O43711 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TLX3O43711 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TLX3O43711 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TLX3O43711 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TLX3O43711 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TLX3O43711 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TLX3O43711 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TLX3O43711 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TLX3O43711 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TLX3O43711 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TLX3O43711 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TLX3O43711 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TLX3O43711 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TLX3O43711 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TLX3O43711 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TLX3O43711 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TLX3O43711 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TLX3O43711 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TLX3O43711 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TLX3O43711 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TLX3O43711 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TLX3O43711 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TLX3O43711 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TLX3O43711 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TLX3O43711 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TLX3O43711 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TLX3O43711 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TLX3O43711 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TLX3O43711 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TLX3O43711 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TLX3O43711 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TLX3O43711 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TLX3O43711 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TLX3O43711 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TLX3O43711 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TLX3O43711 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TLX3O43711 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TLX3O43711 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TLX3O43711 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TLX3O43711 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TLX3O43711 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TLX3O43711 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TLX3O43711 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TLX3O43711 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms