Protein–RNA interactions for Protein: O43448

KCNAB3, Voltage-gated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB3O43448 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNAB3O43448 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNAB3O43448 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNAB3O43448 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNAB3O43448 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNAB3O43448 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNAB3O43448 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNAB3O43448 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNAB3O43448 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNAB3O43448 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNAB3O43448 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNAB3O43448 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNAB3O43448 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNAB3O43448 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNAB3O43448 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNAB3O43448 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNAB3O43448 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNAB3O43448 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNAB3O43448 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNAB3O43448 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNAB3O43448 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNAB3O43448 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNAB3O43448 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNAB3O43448 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNAB3O43448 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNAB3O43448 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNAB3O43448 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNAB3O43448 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNAB3O43448 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNAB3O43448 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNAB3O43448 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNAB3O43448 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNAB3O43448 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNAB3O43448 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNAB3O43448 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNAB3O43448 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNAB3O43448 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNAB3O43448 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNAB3O43448 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNAB3O43448 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNAB3O43448 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNAB3O43448 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNAB3O43448 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNAB3O43448 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNAB3O43448 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNAB3O43448 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNAB3O43448 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNAB3O43448 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNAB3O43448 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNAB3O43448 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNAB3O43448 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNAB3O43448 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNAB3O43448 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNAB3O43448 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNAB3O43448 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNAB3O43448 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNAB3O43448 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNAB3O43448 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNAB3O43448 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNAB3O43448 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNAB3O43448 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNAB3O43448 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNAB3O43448 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNAB3O43448 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNAB3O43448 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNAB3O43448 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNAB3O43448 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNAB3O43448 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNAB3O43448 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNAB3O43448 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNAB3O43448 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNAB3O43448 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNAB3O43448 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KCNAB3O43448 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNAB3O43448 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNAB3O43448 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNAB3O43448 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNAB3O43448 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNAB3O43448 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNAB3O43448 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNAB3O43448 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNAB3O43448 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNAB3O43448 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNAB3O43448 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNAB3O43448 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNAB3O43448 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNAB3O43448 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNAB3O43448 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNAB3O43448 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNAB3O43448 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNAB3O43448 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNAB3O43448 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNAB3O43448 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNAB3O43448 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNAB3O43448 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNAB3O43448 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KCNAB3O43448 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNAB3O43448 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNAB3O43448 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNAB3O43448 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms