Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXC11O43248 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXC11O43248 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXC11O43248 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXC11O43248 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXC11O43248 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXC11O43248 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXC11O43248 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXC11O43248 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXC11O43248 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXC11O43248 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXC11O43248 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXC11O43248 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXC11O43248 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXC11O43248 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXC11O43248 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HOXC11O43248 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HOXC11O43248 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HOXC11O43248 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
HOXC11O43248 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXC11O43248 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXC11O43248 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXC11O43248 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXC11O43248 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXC11O43248 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXC11O43248 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXC11O43248 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXC11O43248 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXC11O43248 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXC11O43248 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXC11O43248 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXC11O43248 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXC11O43248 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXC11O43248 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXC11O43248 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXC11O43248 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXC11O43248 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXC11O43248 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXC11O43248 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXC11O43248 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXC11O43248 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXC11O43248 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
HOXC11O43248 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXC11O43248 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXC11O43248 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXC11O43248 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXC11O43248 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXC11O43248 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXC11O43248 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXC11O43248 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXC11O43248 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXC11O43248 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXC11O43248 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXC11O43248 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXC11O43248 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXC11O43248 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXC11O43248 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXC11O43248 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXC11O43248 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXC11O43248 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXC11O43248 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXC11O43248 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXC11O43248 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXC11O43248 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXC11O43248 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXC11O43248 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXC11O43248 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXC11O43248 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXC11O43248 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXC11O43248 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXC11O43248 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXC11O43248 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXC11O43248 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXC11O43248 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXC11O43248 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXC11O43248 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXC11O43248 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXC11O43248 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXC11O43248 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXC11O43248 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXC11O43248 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXC11O43248 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXC11O43248 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXC11O43248 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXC11O43248 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXC11O43248 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXC11O43248 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXC11O43248 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXC11O43248 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXC11O43248 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXC11O43248 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXC11O43248 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXC11O43248 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXC11O43248 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXC11O43248 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXC11O43248 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXC11O43248 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXC11O43248 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXC11O43248 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXC11O43248 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms