Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNPHO15079 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNPHO15079 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNPHO15079 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNPHO15079 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNPHO15079 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNPHO15079 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNPHO15079 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNPHO15079 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SNPHO15079 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNPHO15079 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNPHO15079 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNPHO15079 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNPHO15079 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNPHO15079 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNPHO15079 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNPHO15079 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNPHO15079 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNPHO15079 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNPHO15079 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNPHO15079 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNPHO15079 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNPHO15079 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SNPHO15079 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNPHO15079 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNPHO15079 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNPHO15079 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNPHO15079 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNPHO15079 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNPHO15079 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNPHO15079 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNPHO15079 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNPHO15079 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNPHO15079 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNPHO15079 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNPHO15079 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNPHO15079 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNPHO15079 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNPHO15079 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNPHO15079 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNPHO15079 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNPHO15079 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNPHO15079 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNPHO15079 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNPHO15079 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNPHO15079 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SNPHO15079 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNPHO15079 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNPHO15079 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SNPHO15079 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNPHO15079 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNPHO15079 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNPHO15079 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNPHO15079 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNPHO15079 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNPHO15079 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SNPHO15079 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNPHO15079 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNPHO15079 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNPHO15079 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNPHO15079 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNPHO15079 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNPHO15079 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNPHO15079 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNPHO15079 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNPHO15079 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNPHO15079 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNPHO15079 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNPHO15079 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNPHO15079 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNPHO15079 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNPHO15079 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNPHO15079 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNPHO15079 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNPHO15079 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNPHO15079 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SNPHO15079 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNPHO15079 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNPHO15079 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNPHO15079 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNPHO15079 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNPHO15079 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNPHO15079 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNPHO15079 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNPHO15079 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNPHO15079 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SNPHO15079 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNPHO15079 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNPHO15079 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNPHO15079 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNPHO15079 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNPHO15079 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNPHO15079 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNPHO15079 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNPHO15079 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNPHO15079 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNPHO15079 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNPHO15079 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNPHO15079 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNPHO15079 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms