Protein–RNA interactions for Protein: O14818

PSMA7, Proteasome subunit alpha type-7, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA7O14818 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSMA7O14818 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSMA7O14818 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSMA7O14818 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PSMA7O14818 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PSMA7O14818 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PSMA7O14818 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PSMA7O14818 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSMA7O14818 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSMA7O14818 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSMA7O14818 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSMA7O14818 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSMA7O14818 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PSMA7O14818 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSMA7O14818 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSMA7O14818 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSMA7O14818 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PSMA7O14818 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSMA7O14818 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PSMA7O14818 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSMA7O14818 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSMA7O14818 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSMA7O14818 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSMA7O14818 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSMA7O14818 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSMA7O14818 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PSMA7O14818 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PSMA7O14818 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PSMA7O14818 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PSMA7O14818 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
PSMA7O14818 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSMA7O14818 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PSMA7O14818 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PSMA7O14818 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PSMA7O14818 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PSMA7O14818 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PSMA7O14818 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PSMA7O14818 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PSMA7O14818 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSMA7O14818 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSMA7O14818 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PSMA7O14818 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSMA7O14818 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSMA7O14818 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSMA7O14818 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSMA7O14818 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PSMA7O14818 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PSMA7O14818 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PSMA7O14818 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSMA7O14818 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSMA7O14818 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSMA7O14818 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSMA7O14818 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSMA7O14818 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSMA7O14818 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSMA7O14818 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PSMA7O14818 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PSMA7O14818 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PSMA7O14818 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PSMA7O14818 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PSMA7O14818 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSMA7O14818 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSMA7O14818 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSMA7O14818 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PSMA7O14818 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSMA7O14818 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSMA7O14818 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSMA7O14818 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSMA7O14818 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSMA7O14818 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSMA7O14818 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSMA7O14818 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSMA7O14818 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PSMA7O14818 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PSMA7O14818 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PSMA7O14818 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSMA7O14818 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSMA7O14818 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSMA7O14818 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSMA7O14818 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PSMA7O14818 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PSMA7O14818 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PSMA7O14818 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PSMA7O14818 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PSMA7O14818 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PSMA7O14818 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PSMA7O14818 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PSMA7O14818 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PSMA7O14818 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PSMA7O14818 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PSMA7O14818 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSMA7O14818 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PSMA7O14818 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSMA7O14818 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PSMA7O14818 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PSMA7O14818 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PSMA7O14818 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSMA7O14818 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSMA7O14818 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSMA7O14818 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145 ms