Protein–RNA interactions for Protein: O00294

TULP1, Tubby-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1O00294 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TULP1O00294 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TULP1O00294 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TULP1O00294 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TULP1O00294 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TULP1O00294 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TULP1O00294 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TULP1O00294 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TULP1O00294 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TULP1O00294 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TULP1O00294 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TULP1O00294 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TULP1O00294 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TULP1O00294 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TULP1O00294 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TULP1O00294 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TULP1O00294 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TULP1O00294 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TULP1O00294 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TULP1O00294 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TULP1O00294 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TULP1O00294 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TULP1O00294 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TULP1O00294 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TULP1O00294 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TULP1O00294 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TULP1O00294 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TULP1O00294 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TULP1O00294 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TULP1O00294 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TULP1O00294 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TULP1O00294 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TULP1O00294 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TULP1O00294 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TULP1O00294 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TULP1O00294 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TULP1O00294 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TULP1O00294 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TULP1O00294 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TULP1O00294 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TULP1O00294 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TULP1O00294 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TULP1O00294 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TULP1O00294 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TULP1O00294 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TULP1O00294 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TULP1O00294 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TULP1O00294 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TULP1O00294 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TULP1O00294 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TULP1O00294 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TULP1O00294 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
TULP1O00294 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TULP1O00294 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TULP1O00294 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TULP1O00294 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TULP1O00294 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TULP1O00294 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TULP1O00294 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TULP1O00294 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TULP1O00294 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TULP1O00294 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TULP1O00294 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TULP1O00294 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TULP1O00294 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TULP1O00294 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TULP1O00294 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TULP1O00294 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TULP1O00294 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TULP1O00294 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TULP1O00294 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TULP1O00294 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TULP1O00294 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TULP1O00294 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TULP1O00294 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TULP1O00294 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TULP1O00294 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TULP1O00294 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TULP1O00294 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TULP1O00294 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TULP1O00294 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TULP1O00294 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TULP1O00294 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TULP1O00294 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TULP1O00294 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TULP1O00294 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TULP1O00294 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TULP1O00294 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TULP1O00294 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TULP1O00294 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TULP1O00294 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TULP1O00294 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TULP1O00294 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TULP1O00294 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TULP1O00294 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TULP1O00294 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TULP1O00294 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TULP1O00294 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TULP1O00294 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TULP1O00294 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms