Protein–RNA interactions for Protein: A8MT33

SYCE1L, Synaptonemal complex central element protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1LA8MT33 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCE1LA8MT33 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCE1LA8MT33 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCE1LA8MT33 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCE1LA8MT33 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCE1LA8MT33 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCE1LA8MT33 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCE1LA8MT33 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYCE1LA8MT33 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYCE1LA8MT33 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYCE1LA8MT33 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYCE1LA8MT33 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYCE1LA8MT33 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYCE1LA8MT33 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYCE1LA8MT33 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYCE1LA8MT33 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SYCE1LA8MT33 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCE1LA8MT33 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCE1LA8MT33 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCE1LA8MT33 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCE1LA8MT33 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCE1LA8MT33 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCE1LA8MT33 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCE1LA8MT33 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCE1LA8MT33 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYCE1LA8MT33 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYCE1LA8MT33 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYCE1LA8MT33 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYCE1LA8MT33 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYCE1LA8MT33 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCE1LA8MT33 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCE1LA8MT33 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCE1LA8MT33 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCE1LA8MT33 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCE1LA8MT33 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCE1LA8MT33 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYCE1LA8MT33 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SYCE1LA8MT33 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYCE1LA8MT33 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SYCE1LA8MT33 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYCE1LA8MT33 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYCE1LA8MT33 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCE1LA8MT33 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCE1LA8MT33 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCE1LA8MT33 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYCE1LA8MT33 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYCE1LA8MT33 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYCE1LA8MT33 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYCE1LA8MT33 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCE1LA8MT33 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCE1LA8MT33 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCE1LA8MT33 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCE1LA8MT33 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCE1LA8MT33 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCE1LA8MT33 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCE1LA8MT33 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYCE1LA8MT33 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYCE1LA8MT33 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SYCE1LA8MT33 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYCE1LA8MT33 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCE1LA8MT33 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCE1LA8MT33 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCE1LA8MT33 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCE1LA8MT33 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCE1LA8MT33 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCE1LA8MT33 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCE1LA8MT33 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCE1LA8MT33 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCE1LA8MT33 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCE1LA8MT33 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCE1LA8MT33 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCE1LA8MT33 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYCE1LA8MT33 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYCE1LA8MT33 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SYCE1LA8MT33 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYCE1LA8MT33 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCE1LA8MT33 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCE1LA8MT33 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCE1LA8MT33 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCE1LA8MT33 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCE1LA8MT33 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCE1LA8MT33 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCE1LA8MT33 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCE1LA8MT33 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCE1LA8MT33 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCE1LA8MT33 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCE1LA8MT33 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCE1LA8MT33 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCE1LA8MT33 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCE1LA8MT33 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCE1LA8MT33 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCE1LA8MT33 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCE1LA8MT33 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCE1LA8MT33 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCE1LA8MT33 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCE1LA8MT33 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SYCE1LA8MT33 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SYCE1LA8MT33 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SYCE1LA8MT33 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCE1LA8MT33 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms