Protein–RNA interactions for Protein: A6NKU9

SPDYE3, Speedy protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYE3A6NKU9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SPDYE3A6NKU9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SPDYE3A6NKU9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SPDYE3A6NKU9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SPDYE3A6NKU9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SPDYE3A6NKU9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SPDYE3A6NKU9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SPDYE3A6NKU9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SPDYE3A6NKU9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SPDYE3A6NKU9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SPDYE3A6NKU9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SPDYE3A6NKU9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SPDYE3A6NKU9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SPDYE3A6NKU9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SPDYE3A6NKU9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SPDYE3A6NKU9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SPDYE3A6NKU9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SPDYE3A6NKU9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SPDYE3A6NKU9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SPDYE3A6NKU9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SPDYE3A6NKU9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SPDYE3A6NKU9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SPDYE3A6NKU9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SPDYE3A6NKU9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SPDYE3A6NKU9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
SPDYE3A6NKU9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
SPDYE3A6NKU9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SPDYE3A6NKU9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SPDYE3A6NKU9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SPDYE3A6NKU9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SPDYE3A6NKU9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SPDYE3A6NKU9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SPDYE3A6NKU9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SPDYE3A6NKU9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SPDYE3A6NKU9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SPDYE3A6NKU9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SPDYE3A6NKU9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SPDYE3A6NKU9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SPDYE3A6NKU9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
SPDYE3A6NKU9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SPDYE3A6NKU9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
SPDYE3A6NKU9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SPDYE3A6NKU9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SPDYE3A6NKU9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SPDYE3A6NKU9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SPDYE3A6NKU9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SPDYE3A6NKU9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SPDYE3A6NKU9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SPDYE3A6NKU9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SPDYE3A6NKU9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SPDYE3A6NKU9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
SPDYE3A6NKU9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SPDYE3A6NKU9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SPDYE3A6NKU9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SPDYE3A6NKU9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SPDYE3A6NKU9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SPDYE3A6NKU9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SPDYE3A6NKU9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SPDYE3A6NKU9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SPDYE3A6NKU9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SPDYE3A6NKU9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SPDYE3A6NKU9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SPDYE3A6NKU9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SPDYE3A6NKU9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SPDYE3A6NKU9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
SPDYE3A6NKU9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SPDYE3A6NKU9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SPDYE3A6NKU9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SPDYE3A6NKU9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SPDYE3A6NKU9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SPDYE3A6NKU9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SPDYE3A6NKU9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SPDYE3A6NKU9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SPDYE3A6NKU9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SPDYE3A6NKU9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SPDYE3A6NKU9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SPDYE3A6NKU9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SPDYE3A6NKU9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SPDYE3A6NKU9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SPDYE3A6NKU9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SPDYE3A6NKU9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SPDYE3A6NKU9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SPDYE3A6NKU9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SPDYE3A6NKU9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SPDYE3A6NKU9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SPDYE3A6NKU9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SPDYE3A6NKU9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SPDYE3A6NKU9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SPDYE3A6NKU9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SPDYE3A6NKU9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SPDYE3A6NKU9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SPDYE3A6NKU9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SPDYE3A6NKU9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SPDYE3A6NKU9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SPDYE3A6NKU9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SPDYE3A6NKU9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SPDYE3A6NKU9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SPDYE3A6NKU9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SPDYE3A6NKU9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SPDYE3A6NKU9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms