Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SDR42E2A6NKP2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SDR42E2A6NKP2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SDR42E2A6NKP2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SDR42E2A6NKP2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SDR42E2A6NKP2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SDR42E2A6NKP2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SDR42E2A6NKP2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SDR42E2A6NKP2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SDR42E2A6NKP2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SDR42E2A6NKP2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SDR42E2A6NKP2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SDR42E2A6NKP2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SDR42E2A6NKP2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SDR42E2A6NKP2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SDR42E2A6NKP2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SDR42E2A6NKP2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SDR42E2A6NKP2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SDR42E2A6NKP2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SDR42E2A6NKP2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SDR42E2A6NKP2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SDR42E2A6NKP2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SDR42E2A6NKP2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SDR42E2A6NKP2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SDR42E2A6NKP2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SDR42E2A6NKP2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SDR42E2A6NKP2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SDR42E2A6NKP2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SDR42E2A6NKP2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SDR42E2A6NKP2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SDR42E2A6NKP2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SDR42E2A6NKP2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SDR42E2A6NKP2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SDR42E2A6NKP2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SDR42E2A6NKP2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SDR42E2A6NKP2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SDR42E2A6NKP2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SDR42E2A6NKP2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SDR42E2A6NKP2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SDR42E2A6NKP2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SDR42E2A6NKP2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SDR42E2A6NKP2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SDR42E2A6NKP2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SDR42E2A6NKP2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SDR42E2A6NKP2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SDR42E2A6NKP2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SDR42E2A6NKP2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SDR42E2A6NKP2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SDR42E2A6NKP2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SDR42E2A6NKP2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SDR42E2A6NKP2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SDR42E2A6NKP2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SDR42E2A6NKP2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SDR42E2A6NKP2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SDR42E2A6NKP2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SDR42E2A6NKP2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SDR42E2A6NKP2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SDR42E2A6NKP2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SDR42E2A6NKP2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SDR42E2A6NKP2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SDR42E2A6NKP2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SDR42E2A6NKP2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SDR42E2A6NKP2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SDR42E2A6NKP2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SDR42E2A6NKP2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SDR42E2A6NKP2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SDR42E2A6NKP2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SDR42E2A6NKP2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SDR42E2A6NKP2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SDR42E2A6NKP2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SDR42E2A6NKP2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SDR42E2A6NKP2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SDR42E2A6NKP2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SDR42E2A6NKP2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SDR42E2A6NKP2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SDR42E2A6NKP2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SDR42E2A6NKP2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SDR42E2A6NKP2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SDR42E2A6NKP2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SDR42E2A6NKP2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SDR42E2A6NKP2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SDR42E2A6NKP2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SDR42E2A6NKP2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SDR42E2A6NKP2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SDR42E2A6NKP2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SDR42E2A6NKP2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SDR42E2A6NKP2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SDR42E2A6NKP2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SDR42E2A6NKP2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SDR42E2A6NKP2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SDR42E2A6NKP2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SDR42E2A6NKP2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SDR42E2A6NKP2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SDR42E2A6NKP2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SDR42E2A6NKP2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SDR42E2A6NKP2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SDR42E2A6NKP2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SDR42E2A6NKP2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SDR42E2A6NKP2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SDR42E2A6NKP2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms