Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM200CA6NKL6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM200CA6NKL6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM200CA6NKL6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM200CA6NKL6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM200CA6NKL6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM200CA6NKL6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM200CA6NKL6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM200CA6NKL6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM200CA6NKL6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM200CA6NKL6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM200CA6NKL6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM200CA6NKL6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM200CA6NKL6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM200CA6NKL6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM200CA6NKL6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM200CA6NKL6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM200CA6NKL6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM200CA6NKL6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM200CA6NKL6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM200CA6NKL6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM200CA6NKL6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM200CA6NKL6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM200CA6NKL6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM200CA6NKL6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM200CA6NKL6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM200CA6NKL6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM200CA6NKL6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM200CA6NKL6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM200CA6NKL6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM200CA6NKL6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM200CA6NKL6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM200CA6NKL6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM200CA6NKL6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM200CA6NKL6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM200CA6NKL6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM200CA6NKL6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM200CA6NKL6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM200CA6NKL6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM200CA6NKL6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM200CA6NKL6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM200CA6NKL6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM200CA6NKL6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM200CA6NKL6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM200CA6NKL6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM200CA6NKL6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM200CA6NKL6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM200CA6NKL6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM200CA6NKL6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM200CA6NKL6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM200CA6NKL6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM200CA6NKL6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM200CA6NKL6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM200CA6NKL6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM200CA6NKL6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM200CA6NKL6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM200CA6NKL6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM200CA6NKL6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM200CA6NKL6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM200CA6NKL6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM200CA6NKL6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM200CA6NKL6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM200CA6NKL6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM200CA6NKL6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM200CA6NKL6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM200CA6NKL6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM200CA6NKL6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM200CA6NKL6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM200CA6NKL6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM200CA6NKL6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM200CA6NKL6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM200CA6NKL6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM200CA6NKL6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM200CA6NKL6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM200CA6NKL6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM200CA6NKL6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM200CA6NKL6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM200CA6NKL6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM200CA6NKL6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM200CA6NKL6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM200CA6NKL6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM200CA6NKL6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM200CA6NKL6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM200CA6NKL6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM200CA6NKL6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM200CA6NKL6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM200CA6NKL6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM200CA6NKL6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM200CA6NKL6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM200CA6NKL6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM200CA6NKL6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM200CA6NKL6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM200CA6NKL6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM200CA6NKL6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM200CA6NKL6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM200CA6NKL6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM200CA6NKL6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM200CA6NKL6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMEM200CA6NKL6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM200CA6NKL6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms