Protein–RNA interactions for Protein: A6NDD5

SYNDIG1L, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1LA6NDD5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNDIG1LA6NDD5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNDIG1LA6NDD5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNDIG1LA6NDD5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNDIG1LA6NDD5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNDIG1LA6NDD5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNDIG1LA6NDD5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNDIG1LA6NDD5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNDIG1LA6NDD5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNDIG1LA6NDD5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNDIG1LA6NDD5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNDIG1LA6NDD5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNDIG1LA6NDD5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNDIG1LA6NDD5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNDIG1LA6NDD5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNDIG1LA6NDD5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNDIG1LA6NDD5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNDIG1LA6NDD5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNDIG1LA6NDD5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNDIG1LA6NDD5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNDIG1LA6NDD5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNDIG1LA6NDD5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNDIG1LA6NDD5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNDIG1LA6NDD5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNDIG1LA6NDD5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNDIG1LA6NDD5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNDIG1LA6NDD5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNDIG1LA6NDD5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNDIG1LA6NDD5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNDIG1LA6NDD5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNDIG1LA6NDD5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNDIG1LA6NDD5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNDIG1LA6NDD5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNDIG1LA6NDD5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNDIG1LA6NDD5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNDIG1LA6NDD5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNDIG1LA6NDD5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNDIG1LA6NDD5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNDIG1LA6NDD5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNDIG1LA6NDD5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNDIG1LA6NDD5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNDIG1LA6NDD5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNDIG1LA6NDD5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNDIG1LA6NDD5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNDIG1LA6NDD5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNDIG1LA6NDD5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNDIG1LA6NDD5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNDIG1LA6NDD5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNDIG1LA6NDD5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNDIG1LA6NDD5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SYNDIG1LA6NDD5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNDIG1LA6NDD5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNDIG1LA6NDD5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNDIG1LA6NDD5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNDIG1LA6NDD5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNDIG1LA6NDD5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNDIG1LA6NDD5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNDIG1LA6NDD5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNDIG1LA6NDD5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNDIG1LA6NDD5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNDIG1LA6NDD5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNDIG1LA6NDD5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNDIG1LA6NDD5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNDIG1LA6NDD5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNDIG1LA6NDD5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNDIG1LA6NDD5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNDIG1LA6NDD5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNDIG1LA6NDD5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNDIG1LA6NDD5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNDIG1LA6NDD5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNDIG1LA6NDD5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNDIG1LA6NDD5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNDIG1LA6NDD5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNDIG1LA6NDD5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNDIG1LA6NDD5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNDIG1LA6NDD5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNDIG1LA6NDD5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNDIG1LA6NDD5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNDIG1LA6NDD5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNDIG1LA6NDD5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNDIG1LA6NDD5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNDIG1LA6NDD5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNDIG1LA6NDD5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNDIG1LA6NDD5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNDIG1LA6NDD5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNDIG1LA6NDD5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SYNDIG1LA6NDD5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SYNDIG1LA6NDD5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNDIG1LA6NDD5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNDIG1LA6NDD5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SYNDIG1LA6NDD5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNDIG1LA6NDD5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNDIG1LA6NDD5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNDIG1LA6NDD5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNDIG1LA6NDD5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNDIG1LA6NDD5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNDIG1LA6NDD5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNDIG1LA6NDD5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms