Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
LAMB4A4D0S4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
LAMB4A4D0S4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
LAMB4A4D0S4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
LAMB4A4D0S4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
LAMB4A4D0S4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
LAMB4A4D0S4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
LAMB4A4D0S4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
LAMB4A4D0S4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
LAMB4A4D0S4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
LAMB4A4D0S4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
LAMB4A4D0S4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
LAMB4A4D0S4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
LAMB4A4D0S4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
LAMB4A4D0S4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
LAMB4A4D0S4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
LAMB4A4D0S4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
LAMB4A4D0S4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
LAMB4A4D0S4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
LAMB4A4D0S4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
LAMB4A4D0S4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
LAMB4A4D0S4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
LAMB4A4D0S4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
LAMB4A4D0S4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
LAMB4A4D0S4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
LAMB4A4D0S4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
LAMB4A4D0S4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
LAMB4A4D0S4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
LAMB4A4D0S4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
LAMB4A4D0S4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
LAMB4A4D0S4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
LAMB4A4D0S4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
LAMB4A4D0S4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
LAMB4A4D0S4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
LAMB4A4D0S4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
LAMB4A4D0S4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
LAMB4A4D0S4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
LAMB4A4D0S4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
LAMB4A4D0S4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
LAMB4A4D0S4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
LAMB4A4D0S4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
LAMB4A4D0S4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
LAMB4A4D0S4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
LAMB4A4D0S4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
LAMB4A4D0S4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
LAMB4A4D0S4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
LAMB4A4D0S4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
LAMB4A4D0S4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
LAMB4A4D0S4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
LAMB4A4D0S4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
LAMB4A4D0S4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
LAMB4A4D0S4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
LAMB4A4D0S4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
LAMB4A4D0S4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
LAMB4A4D0S4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
LAMB4A4D0S4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
LAMB4A4D0S4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
LAMB4A4D0S4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
LAMB4A4D0S4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
LAMB4A4D0S4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
LAMB4A4D0S4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
LAMB4A4D0S4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
LAMB4A4D0S4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
LAMB4A4D0S4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
LAMB4A4D0S4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
LAMB4A4D0S4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
LAMB4A4D0S4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
LAMB4A4D0S4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
LAMB4A4D0S4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
LAMB4A4D0S4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
LAMB4A4D0S4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
LAMB4A4D0S4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
LAMB4A4D0S4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
LAMB4A4D0S4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
LAMB4A4D0S4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
LAMB4A4D0S4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
LAMB4A4D0S4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
LAMB4A4D0S4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
LAMB4A4D0S4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
LAMB4A4D0S4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
LAMB4A4D0S4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
LAMB4A4D0S4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
LAMB4A4D0S4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
LAMB4A4D0S4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
LAMB4A4D0S4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
LAMB4A4D0S4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
LAMB4A4D0S4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
LAMB4A4D0S4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
LAMB4A4D0S4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
LAMB4A4D0S4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
LAMB4A4D0S4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
LAMB4A4D0S4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
LAMB4A4D0S4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
LAMB4A4D0S4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
LAMB4A4D0S4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
LAMB4A4D0S4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
LAMB4A4D0S4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
LAMB4A4D0S4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
LAMB4A4D0S4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
LAMB4A4D0S4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms