Protein–RNA interactions for Protein: A0PJX0

CIB4, Calcium and integrin-binding family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIB4A0PJX0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CIB4A0PJX0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CIB4A0PJX0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CIB4A0PJX0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CIB4A0PJX0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CIB4A0PJX0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CIB4A0PJX0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CIB4A0PJX0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CIB4A0PJX0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CIB4A0PJX0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CIB4A0PJX0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CIB4A0PJX0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CIB4A0PJX0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CIB4A0PJX0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CIB4A0PJX0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CIB4A0PJX0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CIB4A0PJX0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CIB4A0PJX0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CIB4A0PJX0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CIB4A0PJX0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CIB4A0PJX0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CIB4A0PJX0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CIB4A0PJX0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CIB4A0PJX0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CIB4A0PJX0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CIB4A0PJX0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CIB4A0PJX0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CIB4A0PJX0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CIB4A0PJX0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CIB4A0PJX0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CIB4A0PJX0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CIB4A0PJX0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CIB4A0PJX0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CIB4A0PJX0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CIB4A0PJX0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CIB4A0PJX0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CIB4A0PJX0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CIB4A0PJX0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CIB4A0PJX0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CIB4A0PJX0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CIB4A0PJX0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CIB4A0PJX0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CIB4A0PJX0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CIB4A0PJX0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CIB4A0PJX0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CIB4A0PJX0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CIB4A0PJX0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CIB4A0PJX0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CIB4A0PJX0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CIB4A0PJX0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CIB4A0PJX0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CIB4A0PJX0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CIB4A0PJX0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CIB4A0PJX0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CIB4A0PJX0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CIB4A0PJX0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CIB4A0PJX0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CIB4A0PJX0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CIB4A0PJX0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CIB4A0PJX0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CIB4A0PJX0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CIB4A0PJX0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CIB4A0PJX0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CIB4A0PJX0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CIB4A0PJX0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIB4A0PJX0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIB4A0PJX0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIB4A0PJX0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIB4A0PJX0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIB4A0PJX0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIB4A0PJX0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CIB4A0PJX0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIB4A0PJX0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIB4A0PJX0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIB4A0PJX0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIB4A0PJX0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CIB4A0PJX0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CIB4A0PJX0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CIB4A0PJX0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CIB4A0PJX0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CIB4A0PJX0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CIB4A0PJX0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CIB4A0PJX0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CIB4A0PJX0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIB4A0PJX0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIB4A0PJX0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIB4A0PJX0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIB4A0PJX0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIB4A0PJX0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CIB4A0PJX0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIB4A0PJX0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIB4A0PJX0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIB4A0PJX0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIB4A0PJX0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIB4A0PJX0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIB4A0PJX0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIB4A0PJX0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIB4A0PJX0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIB4A0PJX0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CIB4A0PJX0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms