Protein–RNA interactions for Protein: O00515

LAD1, Ladinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAD1O00515 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAD1O00515 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAD1O00515 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAD1O00515 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAD1O00515 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAD1O00515 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAD1O00515 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAD1O00515 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAD1O00515 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAD1O00515 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAD1O00515 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAD1O00515 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAD1O00515 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAD1O00515 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAD1O00515 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAD1O00515 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAD1O00515 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAD1O00515 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAD1O00515 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAD1O00515 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAD1O00515 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAD1O00515 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LAD1O00515 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LAD1O00515 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAD1O00515 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAD1O00515 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAD1O00515 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAD1O00515 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAD1O00515 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAD1O00515 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAD1O00515 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAD1O00515 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAD1O00515 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAD1O00515 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAD1O00515 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAD1O00515 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAD1O00515 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAD1O00515 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAD1O00515 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAD1O00515 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAD1O00515 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAD1O00515 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAD1O00515 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAD1O00515 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAD1O00515 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAD1O00515 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAD1O00515 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAD1O00515 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAD1O00515 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAD1O00515 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAD1O00515 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAD1O00515 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAD1O00515 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAD1O00515 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LAD1O00515 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAD1O00515 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAD1O00515 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAD1O00515 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAD1O00515 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAD1O00515 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAD1O00515 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAD1O00515 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAD1O00515 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAD1O00515 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAD1O00515 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LAD1O00515 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LAD1O00515 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LAD1O00515 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LAD1O00515 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LAD1O00515 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAD1O00515 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAD1O00515 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAD1O00515 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAD1O00515 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LAD1O00515 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAD1O00515 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAD1O00515 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAD1O00515 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAD1O00515 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAD1O00515 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAD1O00515 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAD1O00515 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LAD1O00515 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAD1O00515 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAD1O00515 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAD1O00515 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAD1O00515 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAD1O00515 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAD1O00515 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAD1O00515 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAD1O00515 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAD1O00515 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAD1O00515 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAD1O00515 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAD1O00515 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAD1O00515 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAD1O00515 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAD1O00515 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAD1O00515 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAD1O00515 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms