RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440975.1

GCC2-AS1-202, GCC2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene GCC2-AS1, Length 574 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC2-AS1-202ENST00000440975 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.29■■■■■ 5.48
GCC2-AS1-202ENST00000440975 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.06■■■■■ 4.64
GCC2-AS1-202ENST00000440975 ABCC9O60706 1549 aa43.22■■■■■ 4.51
GCC2-AS1-202ENST00000440975 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.59■■■■■ 4.25
GCC2-AS1-202ENST00000440975 NACADO15069 1562 aa41.49■■■■■ 4.23
GCC2-AS1-202ENST00000440975 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.21■■■■■ 4.19
GCC2-AS1-202ENST00000440975 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.12■■■■■ 4.17
GCC2-AS1-202ENST00000440975 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41■■■■■ 4.15
GCC2-AS1-202ENST00000440975 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.88■■■■■ 4.13
GCC2-AS1-202ENST00000440975 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.59■■■■■ 4.09
GCC2-AS1-202ENST00000440975 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.27■■■■■ 4.04
GCC2-AS1-202ENST00000440975 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.27■■■■■ 4.04
GCC2-AS1-202ENST00000440975 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.01■■■■■ 4
GCC2-AS1-202ENST00000440975 SCRIBQ14160 1630 aa40■■■■□ 3.99
GCC2-AS1-202ENST00000440975 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.92■■■■□ 3.98
GCC2-AS1-202ENST00000440975 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.25■■■■□ 3.87
GCC2-AS1-202ENST00000440975 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.16■■■■□ 3.86
GCC2-AS1-202ENST00000440975 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.93■■■■□ 3.82
GCC2-AS1-202ENST00000440975 SMARCA4P51532 1647 aa38.31■■■■□ 3.72
GCC2-AS1-202ENST00000440975 NCAPD3P42695 1498 aa38.26■■■■□ 3.72
GCC2-AS1-202ENST00000440975 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.26■■■■□ 3.72
GCC2-AS1-202ENST00000440975 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.18■■■■□ 3.7
GCC2-AS1-202ENST00000440975 SMARCA2P51531 1590 aa38.18■■■■□ 3.7
GCC2-AS1-202ENST00000440975 HMGXB3Q12766 1538 aa38.06■■■■□ 3.68
GCC2-AS1-202ENST00000440975 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.02■■■■□ 3.68
GCC2-AS1-202ENST00000440975 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.91■■■■□ 3.66
GCC2-AS1-202ENST00000440975 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.84■■■■□ 3.65
GCC2-AS1-202ENST00000440975 WIZO95785 1651 aa37.48■■■■□ 3.59
GCC2-AS1-202ENST00000440975 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.38■■■■□ 3.57
GCC2-AS1-202ENST00000440975 ERCC6Q03468 1493 aa37.33■■■■□ 3.57
GCC2-AS1-202ENST00000440975 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.32■■■■□ 3.56
GCC2-AS1-202ENST00000440975 NESP48681 1621 aa37.29■■■■□ 3.56
GCC2-AS1-202ENST00000440975 CUX2O14529 1486 aa37.16■■■■□ 3.54
GCC2-AS1-202ENST00000440975 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.14■■■■□ 3.54
GCC2-AS1-202ENST00000440975 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.09■■■■□ 3.53
GCC2-AS1-202ENST00000440975 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.06■■■■□ 3.52
GCC2-AS1-202ENST00000440975 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.91■■■■□ 3.5
GCC2-AS1-202ENST00000440975 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.91■■■■□ 3.5
GCC2-AS1-202ENST00000440975 CFTRP13569 1480 aa36.82■■■■□ 3.48
GCC2-AS1-202ENST00000440975 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.66■■■■□ 3.46
GCC2-AS1-202ENST00000440975 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.65■■■■□ 3.46
GCC2-AS1-202ENST00000440975 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.65■■■■□ 3.46
GCC2-AS1-202ENST00000440975 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.64■■■■□ 3.46
GCC2-AS1-202ENST00000440975 WDR62O43379 1518 aa36.58■■■■□ 3.45
GCC2-AS1-202ENST00000440975 PRDM2Q13029 1718 aa36.57■■■■□ 3.45
GCC2-AS1-202ENST00000440975 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.33■■■■□ 3.41
GCC2-AS1-202ENST00000440975 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.27■■■■□ 3.4
GCC2-AS1-202ENST00000440975 ABCC8Q09428 1581 aa36.11■■■■□ 3.37
GCC2-AS1-202ENST00000440975 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.05■■■■□ 3.36
GCC2-AS1-202ENST00000440975 TOPBP1Q92547 1522 aa36.02■■■■□ 3.36
GCC2-AS1-202ENST00000440975 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.98■■■■□ 3.35
GCC2-AS1-202ENST00000440975 IFT140Q96RY7 1462 aa35.92■■■■□ 3.34
GCC2-AS1-202ENST00000440975 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.68■■■■□ 3.3
GCC2-AS1-202ENST00000440975 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.67■■■■□ 3.3
GCC2-AS1-202ENST00000440975 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.67■■■■□ 3.3
GCC2-AS1-202ENST00000440975 CUX1P39880 1505 aa35.6■■■■□ 3.29
GCC2-AS1-202ENST00000440975 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.59■■■■□ 3.29
GCC2-AS1-202ENST00000440975 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.54■■■■□ 3.28
GCC2-AS1-202ENST00000440975 SOGA1O94964 1423 aa35.53■■■■□ 3.28
GCC2-AS1-202ENST00000440975 WDR97A6NE52 1622 aa35.5■■■■□ 3.27
GCC2-AS1-202ENST00000440975 OSCARQ8IYS5 282 aa35.49■■■■□ 3.27
GCC2-AS1-202ENST00000440975 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.47■■■■□ 3.27
GCC2-AS1-202ENST00000440975 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.43■■■■□ 3.26
GCC2-AS1-202ENST00000440975 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.31■■■■□ 3.24
GCC2-AS1-202ENST00000440975 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.28■■■■□ 3.24
GCC2-AS1-202ENST00000440975 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.27■■■■□ 3.24
GCC2-AS1-202ENST00000440975 TOP2BQ02880 1626 aa35.27■■■■□ 3.24
GCC2-AS1-202ENST00000440975 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.24■■■■□ 3.23
GCC2-AS1-202ENST00000440975 CHD1O14646 1710 aa35.19■■■■□ 3.22
GCC2-AS1-202ENST00000440975 GRIN2BQ13224 1484 aa35.19■■■■□ 3.22
GCC2-AS1-202ENST00000440975 SYNJ1O43426 1573 aa35.17■■■■□ 3.22
GCC2-AS1-202ENST00000440975 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.16■■■■□ 3.22
GCC2-AS1-202ENST00000440975 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.13■■■■□ 3.21
GCC2-AS1-202ENST00000440975 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.13■■■■□ 3.21
GCC2-AS1-202ENST00000440975 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.12■■■■□ 3.21
GCC2-AS1-202ENST00000440975 PBRM1Q86U86 1689 aa35.08■■■■□ 3.21
GCC2-AS1-202ENST00000440975 FBLN2P98095 1184 aa35.03■■■■□ 3.2
GCC2-AS1-202ENST00000440975 SYNJ2O15056 1496 aa35.01■■■■□ 3.19
GCC2-AS1-202ENST00000440975 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.96■■■■□ 3.19
GCC2-AS1-202ENST00000440975 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.94■■■■□ 3.18
GCC2-AS1-202ENST00000440975 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.94■■■■□ 3.18
GCC2-AS1-202ENST00000440975 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.94■■■■□ 3.18
GCC2-AS1-202ENST00000440975 ARHGEF11O15085 1522 aa34.91■■■■□ 3.18
GCC2-AS1-202ENST00000440975 TRIM41Q8WV44 630 aa34.85■■■■□ 3.17
GCC2-AS1-202ENST00000440975 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.84■■■■□ 3.17
GCC2-AS1-202ENST00000440975 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.84■■■■□ 3.17
GCC2-AS1-202ENST00000440975 ADAMTS12P58397 1594 aa34.79■■■■□ 3.16
GCC2-AS1-202ENST00000440975 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.73■■■■□ 3.15
GCC2-AS1-202ENST00000440975 GRIN2AQ12879 1464 aa34.72■■■■□ 3.15
GCC2-AS1-202ENST00000440975 NUP160Q12769 1436 aa34.61■■■■□ 3.13
GCC2-AS1-202ENST00000440975 KIF27Q86VH2 1401 aa34.59■■■■□ 3.13
GCC2-AS1-202ENST00000440975 ARAP1Q96P48 1450 aa34.58■■■■□ 3.13
GCC2-AS1-202ENST00000440975 CEP170Q5SW79 1584 aa34.53■■■■□ 3.12
GCC2-AS1-202ENST00000440975 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.53■■■■□ 3.12
GCC2-AS1-202ENST00000440975 CUL7Q14999 1698 aa34.46■■■■□ 3.11
GCC2-AS1-202ENST00000440975 IGF1RP08069 1367 aa34.46■■■■□ 3.11
GCC2-AS1-202ENST00000440975 SHROOM2Q13796 1616 aa34.41■■■■□ 3.1
GCC2-AS1-202ENST00000440975 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.29■■■■□ 3.08
GCC2-AS1-202ENST00000440975 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.24■■■■□ 3.07
GCC2-AS1-202ENST00000440975 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.22■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.4 ms