Protein–RNA interactions for Protein: Q13595

TRA2A, Transformer-2 protein homolog alpha, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2AQ13595 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.026e-6■□□□□ 8.7
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TRA2AQ13595 DCAF11-202ENST00000396936 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.73e-8■□□□□ 8.6
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TRA2AQ13595 RBM39-235ENST00000490354 436 ntTSL 24.22□□□□□ -1.737e-12■□□□□ 8.6
TRA2AQ13595 DCAF11-222ENST00000559396 300 ntTSL 34.06□□□□□ -1.763e-8■□□□□ 8.6
TRA2AQ13595 RBM39-241ENST00000496183 632 ntTSL 23.73□□□□□ -1.817e-12■□□□□ 8.6
TRA2AQ13595 HSPD1-213ENST00000486181 648 ntTSL 23.23□□□□□ -1.893e-8■□□□□ 8.6
TRA2AQ13595 PTMA-207ENST00000440384 222 ntTSL 318.74■□□□□ 0.593e-6■□□□□ 8.6
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TRA2AQ13595 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.333e-6■□□□□ 8.6
TRA2AQ13595 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.273e-6■□□□□ 8.6
TRA2AQ13595 STRN4-218ENST00000600358 1267 ntTSL 515.64■□□□□ 0.093e-6■□□□□ 8.6
TRA2AQ13595 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.093e-6■□□□□ 8.6
TRA2AQ13595 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.093e-6■□□□□ 8.6
TRA2AQ13595 RTN3-211ENST00000542238 735 ntTSL 315.43■□□□□ 0.063e-6■□□□□ 8.6
TRA2AQ13595 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.013e-6■□□□□ 8.6
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