RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498841.5

PFKL-211, Transcript of phosphofructokinase, liver type, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PFKL, Length 3,122 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKL-211ENST00000498841 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.73■■■■□ 3.15
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PFKL-211ENST00000498841 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.09■■■□□ 2.09
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PFKL-211ENST00000498841 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.85■■■□□ 2.05
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PFKL-211ENST00000498841 HRCP23327 699 aa27.35■■□□□ 1.97
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PFKL-211ENST00000498841 PCGF6Q9BYE7 350 aa27.14■■□□□ 1.94
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PFKL-211ENST00000498841 ABCC8Q09428 1581 aa26.46■■□□□ 1.83
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PFKL-211ENST00000498841 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
PFKL-211ENST00000498841 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
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PFKL-211ENST00000498841 SOGA1O94964 1423 aa26.13■■□□□ 1.77
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PFKL-211ENST00000498841 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.05■■□□□ 1.76
PFKL-211ENST00000498841 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
PFKL-211ENST00000498841 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.01■■□□□ 1.75
PFKL-211ENST00000498841 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.91■■□□□ 1.74
PFKL-211ENST00000498841 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.89■■□□□ 1.74
PFKL-211ENST00000498841 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
PFKL-211ENST00000498841 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
PFKL-211ENST00000498841 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
PFKL-211ENST00000498841 CEP162Q5TB80 1403 aa25.75■■□□□ 1.71
PFKL-211ENST00000498841 SYNJ1O43426 1573 aa25.73■■□□□ 1.71
PFKL-211ENST00000498841 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.73■■□□□ 1.71
PFKL-211ENST00000498841 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
PFKL-211ENST00000498841 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
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PFKL-211ENST00000498841 GOLGA3Q08378 1498 aa25.52■■□□□ 1.68
PFKL-211ENST00000498841 EEA1Q15075 1411 aa25.47■■□□□ 1.67
PFKL-211ENST00000498841 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.44■■□□□ 1.66
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PFKL-211ENST00000498841 APLP2Q06481 763 aa25.35■■□□□ 1.65
PFKL-211ENST00000498841 HMGXB3Q12766 1538 aa25.28■■□□□ 1.64
PFKL-211ENST00000498841 CUX1P39880 1505 aa25.26■■□□□ 1.63
PFKL-211ENST00000498841 TOP2BQ02880 1626 aa25.26■■□□□ 1.63
PFKL-211ENST00000498841 NEUROD1Q13562 356 aa25.21■■□□□ 1.63
PFKL-211ENST00000498841 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
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PFKL-211ENST00000498841 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.19■■□□□ 1.62
PFKL-211ENST00000498841 CFTRP13569 1480 aa25.17■■□□□ 1.62
PFKL-211ENST00000498841 KIF21BO75037 1637 aa25.15■■□□□ 1.62
PFKL-211ENST00000498841 P3H3Q8IVL6 736 aa25.1■■□□□ 1.61
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PFKL-211ENST00000498841 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
PFKL-211ENST00000498841 KIF27Q86VH2 1401 aa25.09■■□□□ 1.61
PFKL-211ENST00000498841 CUX2O14529 1486 aa25.08■■□□□ 1.6
PFKL-211ENST00000498841 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.07■■□□□ 1.6
PFKL-211ENST00000498841 NESP48681 1621 aa25.07■■□□□ 1.6
PFKL-211ENST00000498841 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa25.06■■□□□ 1.6
PFKL-211ENST00000498841 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.06■■□□□ 1.6
PFKL-211ENST00000498841 ITGAEP38570 1179 aa25.06■■□□□ 1.6
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PFKL-211ENST00000498841 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.9■■□□□ 1.58
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PFKL-211ENST00000498841 ARAP1Q96P48 1450 aa24.89■■□□□ 1.58
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PFKL-211ENST00000498841 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.74■■□□□ 1.55
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PFKL-211ENST00000498841 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
PFKL-211ENST00000498841 PRDM2Q13029 1718 aa24.69■■□□□ 1.54
PFKL-211ENST00000498841 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
PFKL-211ENST00000498841 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
PFKL-211ENST00000498841 TOPBP1Q92547 1522 aa24.65■■□□□ 1.54
PFKL-211ENST00000498841 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
PFKL-211ENST00000498841 ARID3CA6NKF2 412 aa24.6■■□□□ 1.53
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