Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
GJA3Q9Y6H8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
GJA3Q9Y6H8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
GJA3Q9Y6H8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
GJA3Q9Y6H8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
GJA3Q9Y6H8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
GJA3Q9Y6H8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC31.86■■■□□ 2.69
GJA3Q9Y6H8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
GJA3Q9Y6H8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
GJA3Q9Y6H8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
GJA3Q9Y6H8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
GJA3Q9Y6H8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
GJA3Q9Y6H8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
GJA3Q9Y6H8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
GJA3Q9Y6H8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
GJA3Q9Y6H8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
GJA3Q9Y6H8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
GJA3Q9Y6H8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
GJA3Q9Y6H8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
GJA3Q9Y6H8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
GJA3Q9Y6H8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
GJA3Q9Y6H8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
GJA3Q9Y6H8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
GJA3Q9Y6H8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
GJA3Q9Y6H8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
GJA3Q9Y6H8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
GJA3Q9Y6H8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
GJA3Q9Y6H8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
GJA3Q9Y6H8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
GJA3Q9Y6H8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
GJA3Q9Y6H8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
GJA3Q9Y6H8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
GJA3Q9Y6H8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
GJA3Q9Y6H8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
GJA3Q9Y6H8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
GJA3Q9Y6H8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
GJA3Q9Y6H8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
GJA3Q9Y6H8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
GJA3Q9Y6H8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
GJA3Q9Y6H8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
GJA3Q9Y6H8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
GJA3Q9Y6H8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
GJA3Q9Y6H8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
GJA3Q9Y6H8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
GJA3Q9Y6H8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
GJA3Q9Y6H8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
GJA3Q9Y6H8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC31.71■■■□□ 2.67
GJA3Q9Y6H8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
GJA3Q9Y6H8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
GJA3Q9Y6H8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
GJA3Q9Y6H8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
GJA3Q9Y6H8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
GJA3Q9Y6H8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
GJA3Q9Y6H8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
GJA3Q9Y6H8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
GJA3Q9Y6H8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
GJA3Q9Y6H8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
GJA3Q9Y6H8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
GJA3Q9Y6H8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
GJA3Q9Y6H8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
GJA3Q9Y6H8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
GJA3Q9Y6H8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
GJA3Q9Y6H8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
GJA3Q9Y6H8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
GJA3Q9Y6H8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
GJA3Q9Y6H8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
GJA3Q9Y6H8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
GJA3Q9Y6H8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
GJA3Q9Y6H8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
GJA3Q9Y6H8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
GJA3Q9Y6H8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
GJA3Q9Y6H8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
GJA3Q9Y6H8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
GJA3Q9Y6H8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
GJA3Q9Y6H8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
GJA3Q9Y6H8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
GJA3Q9Y6H8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
GJA3Q9Y6H8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
GJA3Q9Y6H8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
GJA3Q9Y6H8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
GJA3Q9Y6H8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
GJA3Q9Y6H8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
GJA3Q9Y6H8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
GJA3Q9Y6H8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
GJA3Q9Y6H8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
GJA3Q9Y6H8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
GJA3Q9Y6H8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
GJA3Q9Y6H8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
GJA3Q9Y6H8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
GJA3Q9Y6H8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
GJA3Q9Y6H8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
GJA3Q9Y6H8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
GJA3Q9Y6H8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
GJA3Q9Y6H8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
GJA3Q9Y6H8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
GJA3Q9Y6H8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
GJA3Q9Y6H8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
GJA3Q9Y6H8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
GJA3Q9Y6H8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
GJA3Q9Y6H8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.5 ms