Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F1

PCDHB12, Protocadherin beta-12, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB12Q9Y5F1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PCDHB12Q9Y5F1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PCDHB12Q9Y5F1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PCDHB12Q9Y5F1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PCDHB12Q9Y5F1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PCDHB12Q9Y5F1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PCDHB12Q9Y5F1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PCDHB12Q9Y5F1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PCDHB12Q9Y5F1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PCDHB12Q9Y5F1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PCDHB12Q9Y5F1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PCDHB12Q9Y5F1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PCDHB12Q9Y5F1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PCDHB12Q9Y5F1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PCDHB12Q9Y5F1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PCDHB12Q9Y5F1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PCDHB12Q9Y5F1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCDHB12Q9Y5F1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCDHB12Q9Y5F1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PCDHB12Q9Y5F1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCDHB12Q9Y5F1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCDHB12Q9Y5F1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCDHB12Q9Y5F1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PCDHB12Q9Y5F1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PCDHB12Q9Y5F1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCDHB12Q9Y5F1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCDHB12Q9Y5F1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCDHB12Q9Y5F1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCDHB12Q9Y5F1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCDHB12Q9Y5F1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCDHB12Q9Y5F1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDHB12Q9Y5F1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDHB12Q9Y5F1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDHB12Q9Y5F1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCDHB12Q9Y5F1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCDHB12Q9Y5F1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCDHB12Q9Y5F1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PCDHB12Q9Y5F1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCDHB12Q9Y5F1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCDHB12Q9Y5F1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCDHB12Q9Y5F1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCDHB12Q9Y5F1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCDHB12Q9Y5F1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PCDHB12Q9Y5F1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCDHB12Q9Y5F1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHB12Q9Y5F1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHB12Q9Y5F1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHB12Q9Y5F1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHB12Q9Y5F1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHB12Q9Y5F1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PCDHB12Q9Y5F1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PCDHB12Q9Y5F1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PCDHB12Q9Y5F1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PCDHB12Q9Y5F1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHB12Q9Y5F1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHB12Q9Y5F1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHB12Q9Y5F1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHB12Q9Y5F1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHB12Q9Y5F1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDHB12Q9Y5F1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDHB12Q9Y5F1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDHB12Q9Y5F1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDHB12Q9Y5F1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDHB12Q9Y5F1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDHB12Q9Y5F1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDHB12Q9Y5F1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCDHB12Q9Y5F1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PCDHB12Q9Y5F1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
PCDHB12Q9Y5F1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PCDHB12Q9Y5F1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PCDHB12Q9Y5F1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PCDHB12Q9Y5F1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PCDHB12Q9Y5F1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PCDHB12Q9Y5F1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHB12Q9Y5F1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHB12Q9Y5F1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCDHB12Q9Y5F1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCDHB12Q9Y5F1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCDHB12Q9Y5F1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDHB12Q9Y5F1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDHB12Q9Y5F1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDHB12Q9Y5F1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDHB12Q9Y5F1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCDHB12Q9Y5F1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PCDHB12Q9Y5F1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PCDHB12Q9Y5F1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PCDHB12Q9Y5F1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHB12Q9Y5F1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHB12Q9Y5F1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCDHB12Q9Y5F1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCDHB12Q9Y5F1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCDHB12Q9Y5F1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCDHB12Q9Y5F1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCDHB12Q9Y5F1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHB12Q9Y5F1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHB12Q9Y5F1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHB12Q9Y5F1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms