Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y520

PRRC2C, Protein PRRC2C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC2CQ9Y520 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRRC2CQ9Y520 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRRC2CQ9Y520 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRRC2CQ9Y520 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRRC2CQ9Y520 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRRC2CQ9Y520 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRRC2CQ9Y520 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRRC2CQ9Y520 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRRC2CQ9Y520 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRRC2CQ9Y520 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRRC2CQ9Y520 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRRC2CQ9Y520 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRRC2CQ9Y520 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRRC2CQ9Y520 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRRC2CQ9Y520 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRRC2CQ9Y520 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRRC2CQ9Y520 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRRC2CQ9Y520 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRRC2CQ9Y520 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRRC2CQ9Y520 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRRC2CQ9Y520 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRRC2CQ9Y520 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRRC2CQ9Y520 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRRC2CQ9Y520 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRRC2CQ9Y520 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRRC2CQ9Y520 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRRC2CQ9Y520 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRRC2CQ9Y520 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRRC2CQ9Y520 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRRC2CQ9Y520 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRRC2CQ9Y520 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRRC2CQ9Y520 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRRC2CQ9Y520 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PRRC2CQ9Y520 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRRC2CQ9Y520 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRRC2CQ9Y520 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRRC2CQ9Y520 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRRC2CQ9Y520 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRRC2CQ9Y520 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRRC2CQ9Y520 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRRC2CQ9Y520 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRRC2CQ9Y520 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRRC2CQ9Y520 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PRRC2CQ9Y520 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRRC2CQ9Y520 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRRC2CQ9Y520 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRRC2CQ9Y520 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRRC2CQ9Y520 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRRC2CQ9Y520 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRRC2CQ9Y520 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRRC2CQ9Y520 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRRC2CQ9Y520 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRRC2CQ9Y520 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRRC2CQ9Y520 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRRC2CQ9Y520 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRRC2CQ9Y520 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRRC2CQ9Y520 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PRRC2CQ9Y520 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRRC2CQ9Y520 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRRC2CQ9Y520 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRRC2CQ9Y520 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRRC2CQ9Y520 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRRC2CQ9Y520 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRRC2CQ9Y520 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRRC2CQ9Y520 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRRC2CQ9Y520 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRRC2CQ9Y520 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRRC2CQ9Y520 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRRC2CQ9Y520 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRRC2CQ9Y520 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRRC2CQ9Y520 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRRC2CQ9Y520 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRRC2CQ9Y520 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRRC2CQ9Y520 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRRC2CQ9Y520 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRRC2CQ9Y520 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRRC2CQ9Y520 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRRC2CQ9Y520 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRRC2CQ9Y520 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRRC2CQ9Y520 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRRC2CQ9Y520 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRRC2CQ9Y520 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRRC2CQ9Y520 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRRC2CQ9Y520 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRRC2CQ9Y520 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRRC2CQ9Y520 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRRC2CQ9Y520 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRRC2CQ9Y520 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRRC2CQ9Y520 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRRC2CQ9Y520 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRRC2CQ9Y520 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRRC2CQ9Y520 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRRC2CQ9Y520 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRRC2CQ9Y520 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRRC2CQ9Y520 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRRC2CQ9Y520 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PRRC2CQ9Y520 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRRC2CQ9Y520 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRRC2CQ9Y520 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRRC2CQ9Y520 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms