Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
YBX2Q9Y2T7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
YBX2Q9Y2T7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
YBX2Q9Y2T7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
YBX2Q9Y2T7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
YBX2Q9Y2T7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
YBX2Q9Y2T7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
YBX2Q9Y2T7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
YBX2Q9Y2T7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
YBX2Q9Y2T7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
YBX2Q9Y2T7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
YBX2Q9Y2T7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
YBX2Q9Y2T7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
YBX2Q9Y2T7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
YBX2Q9Y2T7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
YBX2Q9Y2T7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
YBX2Q9Y2T7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
YBX2Q9Y2T7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
YBX2Q9Y2T7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
YBX2Q9Y2T7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
YBX2Q9Y2T7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
YBX2Q9Y2T7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
YBX2Q9Y2T7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
YBX2Q9Y2T7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
YBX2Q9Y2T7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
YBX2Q9Y2T7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
YBX2Q9Y2T7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
YBX2Q9Y2T7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
YBX2Q9Y2T7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
YBX2Q9Y2T7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
YBX2Q9Y2T7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
YBX2Q9Y2T7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
YBX2Q9Y2T7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
YBX2Q9Y2T7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
YBX2Q9Y2T7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
YBX2Q9Y2T7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
YBX2Q9Y2T7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
YBX2Q9Y2T7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
YBX2Q9Y2T7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
YBX2Q9Y2T7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
YBX2Q9Y2T7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
YBX2Q9Y2T7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
YBX2Q9Y2T7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
YBX2Q9Y2T7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
YBX2Q9Y2T7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
YBX2Q9Y2T7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
YBX2Q9Y2T7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
YBX2Q9Y2T7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
YBX2Q9Y2T7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
YBX2Q9Y2T7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
YBX2Q9Y2T7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
YBX2Q9Y2T7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
YBX2Q9Y2T7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
YBX2Q9Y2T7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
YBX2Q9Y2T7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
YBX2Q9Y2T7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
YBX2Q9Y2T7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
YBX2Q9Y2T7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
YBX2Q9Y2T7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
YBX2Q9Y2T7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
YBX2Q9Y2T7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
YBX2Q9Y2T7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
YBX2Q9Y2T7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
YBX2Q9Y2T7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
YBX2Q9Y2T7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
YBX2Q9Y2T7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
YBX2Q9Y2T7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
YBX2Q9Y2T7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
YBX2Q9Y2T7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
YBX2Q9Y2T7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
YBX2Q9Y2T7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
YBX2Q9Y2T7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
YBX2Q9Y2T7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
YBX2Q9Y2T7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
YBX2Q9Y2T7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
YBX2Q9Y2T7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
YBX2Q9Y2T7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
YBX2Q9Y2T7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
YBX2Q9Y2T7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
YBX2Q9Y2T7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
YBX2Q9Y2T7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
YBX2Q9Y2T7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
YBX2Q9Y2T7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
YBX2Q9Y2T7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
YBX2Q9Y2T7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
YBX2Q9Y2T7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
YBX2Q9Y2T7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
YBX2Q9Y2T7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
YBX2Q9Y2T7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
YBX2Q9Y2T7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
YBX2Q9Y2T7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
YBX2Q9Y2T7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
YBX2Q9Y2T7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
YBX2Q9Y2T7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
YBX2Q9Y2T7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
YBX2Q9Y2T7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
YBX2Q9Y2T7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
YBX2Q9Y2T7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
YBX2Q9Y2T7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
YBX2Q9Y2T7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 618.8 ms