Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D8

SSX2IP, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2IPQ9Y2D8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SSX2IPQ9Y2D8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SSX2IPQ9Y2D8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SSX2IPQ9Y2D8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SSX2IPQ9Y2D8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SSX2IPQ9Y2D8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SSX2IPQ9Y2D8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SSX2IPQ9Y2D8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SSX2IPQ9Y2D8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SSX2IPQ9Y2D8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SSX2IPQ9Y2D8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SSX2IPQ9Y2D8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SSX2IPQ9Y2D8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SSX2IPQ9Y2D8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SSX2IPQ9Y2D8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SSX2IPQ9Y2D8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SSX2IPQ9Y2D8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SSX2IPQ9Y2D8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SSX2IPQ9Y2D8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SSX2IPQ9Y2D8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SSX2IPQ9Y2D8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SSX2IPQ9Y2D8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SSX2IPQ9Y2D8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SSX2IPQ9Y2D8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SSX2IPQ9Y2D8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SSX2IPQ9Y2D8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SSX2IPQ9Y2D8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SSX2IPQ9Y2D8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SSX2IPQ9Y2D8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SSX2IPQ9Y2D8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SSX2IPQ9Y2D8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SSX2IPQ9Y2D8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SSX2IPQ9Y2D8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SSX2IPQ9Y2D8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SSX2IPQ9Y2D8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
SSX2IPQ9Y2D8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SSX2IPQ9Y2D8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SSX2IPQ9Y2D8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SSX2IPQ9Y2D8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SSX2IPQ9Y2D8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SSX2IPQ9Y2D8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SSX2IPQ9Y2D8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SSX2IPQ9Y2D8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SSX2IPQ9Y2D8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SSX2IPQ9Y2D8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SSX2IPQ9Y2D8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SSX2IPQ9Y2D8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SSX2IPQ9Y2D8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SSX2IPQ9Y2D8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SSX2IPQ9Y2D8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SSX2IPQ9Y2D8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SSX2IPQ9Y2D8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SSX2IPQ9Y2D8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SSX2IPQ9Y2D8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SSX2IPQ9Y2D8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SSX2IPQ9Y2D8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SSX2IPQ9Y2D8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SSX2IPQ9Y2D8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SSX2IPQ9Y2D8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SSX2IPQ9Y2D8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SSX2IPQ9Y2D8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SSX2IPQ9Y2D8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SSX2IPQ9Y2D8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SSX2IPQ9Y2D8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SSX2IPQ9Y2D8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SSX2IPQ9Y2D8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SSX2IPQ9Y2D8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SSX2IPQ9Y2D8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SSX2IPQ9Y2D8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SSX2IPQ9Y2D8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SSX2IPQ9Y2D8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SSX2IPQ9Y2D8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SSX2IPQ9Y2D8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SSX2IPQ9Y2D8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SSX2IPQ9Y2D8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SSX2IPQ9Y2D8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SSX2IPQ9Y2D8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SSX2IPQ9Y2D8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SSX2IPQ9Y2D8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SSX2IPQ9Y2D8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SSX2IPQ9Y2D8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SSX2IPQ9Y2D8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SSX2IPQ9Y2D8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SSX2IPQ9Y2D8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SSX2IPQ9Y2D8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SSX2IPQ9Y2D8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SSX2IPQ9Y2D8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SSX2IPQ9Y2D8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SSX2IPQ9Y2D8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SSX2IPQ9Y2D8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SSX2IPQ9Y2D8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SSX2IPQ9Y2D8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SSX2IPQ9Y2D8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SSX2IPQ9Y2D8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SSX2IPQ9Y2D8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SSX2IPQ9Y2D8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SSX2IPQ9Y2D8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms