Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIGD1AQ9Y241 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIGD1AQ9Y241 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIGD1AQ9Y241 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIGD1AQ9Y241 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIGD1AQ9Y241 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIGD1AQ9Y241 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIGD1AQ9Y241 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIGD1AQ9Y241 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIGD1AQ9Y241 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIGD1AQ9Y241 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIGD1AQ9Y241 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIGD1AQ9Y241 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HIGD1AQ9Y241 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIGD1AQ9Y241 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIGD1AQ9Y241 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIGD1AQ9Y241 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIGD1AQ9Y241 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIGD1AQ9Y241 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIGD1AQ9Y241 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIGD1AQ9Y241 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIGD1AQ9Y241 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIGD1AQ9Y241 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIGD1AQ9Y241 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HIGD1AQ9Y241 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HIGD1AQ9Y241 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HIGD1AQ9Y241 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HIGD1AQ9Y241 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HIGD1AQ9Y241 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIGD1AQ9Y241 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIGD1AQ9Y241 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIGD1AQ9Y241 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIGD1AQ9Y241 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIGD1AQ9Y241 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIGD1AQ9Y241 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIGD1AQ9Y241 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIGD1AQ9Y241 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIGD1AQ9Y241 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIGD1AQ9Y241 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HIGD1AQ9Y241 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HIGD1AQ9Y241 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HIGD1AQ9Y241 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HIGD1AQ9Y241 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIGD1AQ9Y241 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIGD1AQ9Y241 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIGD1AQ9Y241 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HIGD1AQ9Y241 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HIGD1AQ9Y241 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HIGD1AQ9Y241 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HIGD1AQ9Y241 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HIGD1AQ9Y241 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HIGD1AQ9Y241 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HIGD1AQ9Y241 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HIGD1AQ9Y241 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HIGD1AQ9Y241 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HIGD1AQ9Y241 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HIGD1AQ9Y241 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HIGD1AQ9Y241 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HIGD1AQ9Y241 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HIGD1AQ9Y241 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HIGD1AQ9Y241 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HIGD1AQ9Y241 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HIGD1AQ9Y241 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HIGD1AQ9Y241 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HIGD1AQ9Y241 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HIGD1AQ9Y241 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HIGD1AQ9Y241 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HIGD1AQ9Y241 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HIGD1AQ9Y241 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HIGD1AQ9Y241 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HIGD1AQ9Y241 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HIGD1AQ9Y241 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HIGD1AQ9Y241 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HIGD1AQ9Y241 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HIGD1AQ9Y241 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HIGD1AQ9Y241 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HIGD1AQ9Y241 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HIGD1AQ9Y241 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HIGD1AQ9Y241 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HIGD1AQ9Y241 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HIGD1AQ9Y241 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HIGD1AQ9Y241 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HIGD1AQ9Y241 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HIGD1AQ9Y241 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HIGD1AQ9Y241 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HIGD1AQ9Y241 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HIGD1AQ9Y241 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HIGD1AQ9Y241 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HIGD1AQ9Y241 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
HIGD1AQ9Y241 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HIGD1AQ9Y241 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HIGD1AQ9Y241 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIGD1AQ9Y241 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIGD1AQ9Y241 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIGD1AQ9Y241 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HIGD1AQ9Y241 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HIGD1AQ9Y241 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HIGD1AQ9Y241 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HIGD1AQ9Y241 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HIGD1AQ9Y241 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms