Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ52

CNTN6, Contactin-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN6Q9UQ52 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNTN6Q9UQ52 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNTN6Q9UQ52 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNTN6Q9UQ52 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNTN6Q9UQ52 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNTN6Q9UQ52 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CNTN6Q9UQ52 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNTN6Q9UQ52 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNTN6Q9UQ52 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNTN6Q9UQ52 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNTN6Q9UQ52 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNTN6Q9UQ52 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNTN6Q9UQ52 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNTN6Q9UQ52 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNTN6Q9UQ52 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNTN6Q9UQ52 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNTN6Q9UQ52 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNTN6Q9UQ52 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CNTN6Q9UQ52 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNTN6Q9UQ52 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNTN6Q9UQ52 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNTN6Q9UQ52 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CNTN6Q9UQ52 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CNTN6Q9UQ52 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNTN6Q9UQ52 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNTN6Q9UQ52 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNTN6Q9UQ52 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CNTN6Q9UQ52 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNTN6Q9UQ52 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNTN6Q9UQ52 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNTN6Q9UQ52 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNTN6Q9UQ52 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNTN6Q9UQ52 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNTN6Q9UQ52 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNTN6Q9UQ52 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNTN6Q9UQ52 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CNTN6Q9UQ52 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNTN6Q9UQ52 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNTN6Q9UQ52 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNTN6Q9UQ52 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNTN6Q9UQ52 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CNTN6Q9UQ52 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNTN6Q9UQ52 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNTN6Q9UQ52 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNTN6Q9UQ52 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNTN6Q9UQ52 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNTN6Q9UQ52 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNTN6Q9UQ52 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNTN6Q9UQ52 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNTN6Q9UQ52 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNTN6Q9UQ52 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNTN6Q9UQ52 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNTN6Q9UQ52 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNTN6Q9UQ52 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNTN6Q9UQ52 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNTN6Q9UQ52 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNTN6Q9UQ52 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNTN6Q9UQ52 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNTN6Q9UQ52 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNTN6Q9UQ52 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNTN6Q9UQ52 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
CNTN6Q9UQ52 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CNTN6Q9UQ52 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CNTN6Q9UQ52 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CNTN6Q9UQ52 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CNTN6Q9UQ52 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CNTN6Q9UQ52 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CNTN6Q9UQ52 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CNTN6Q9UQ52 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CNTN6Q9UQ52 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CNTN6Q9UQ52 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
CNTN6Q9UQ52 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CNTN6Q9UQ52 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CNTN6Q9UQ52 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
CNTN6Q9UQ52 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
CNTN6Q9UQ52 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNTN6Q9UQ52 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNTN6Q9UQ52 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNTN6Q9UQ52 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNTN6Q9UQ52 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNTN6Q9UQ52 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNTN6Q9UQ52 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNTN6Q9UQ52 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNTN6Q9UQ52 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNTN6Q9UQ52 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNTN6Q9UQ52 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNTN6Q9UQ52 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CNTN6Q9UQ52 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNTN6Q9UQ52 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNTN6Q9UQ52 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNTN6Q9UQ52 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNTN6Q9UQ52 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNTN6Q9UQ52 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNTN6Q9UQ52 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNTN6Q9UQ52 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNTN6Q9UQ52 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CNTN6Q9UQ52 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CNTN6Q9UQ52 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CNTN6Q9UQ52 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CNTN6Q9UQ52 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms