Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
HPS5Q9UPZ3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
HPS5Q9UPZ3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
HPS5Q9UPZ3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
HPS5Q9UPZ3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
HPS5Q9UPZ3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
HPS5Q9UPZ3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
HPS5Q9UPZ3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
HPS5Q9UPZ3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
HPS5Q9UPZ3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
HPS5Q9UPZ3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
HPS5Q9UPZ3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
HPS5Q9UPZ3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
HPS5Q9UPZ3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
HPS5Q9UPZ3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
HPS5Q9UPZ3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
HPS5Q9UPZ3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
HPS5Q9UPZ3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
HPS5Q9UPZ3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
HPS5Q9UPZ3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
HPS5Q9UPZ3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
HPS5Q9UPZ3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
HPS5Q9UPZ3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
HPS5Q9UPZ3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
HPS5Q9UPZ3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
HPS5Q9UPZ3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
HPS5Q9UPZ3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
HPS5Q9UPZ3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
HPS5Q9UPZ3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
HPS5Q9UPZ3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
HPS5Q9UPZ3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
HPS5Q9UPZ3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
HPS5Q9UPZ3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
HPS5Q9UPZ3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
HPS5Q9UPZ3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
HPS5Q9UPZ3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
HPS5Q9UPZ3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
HPS5Q9UPZ3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
HPS5Q9UPZ3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
HPS5Q9UPZ3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
HPS5Q9UPZ3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
HPS5Q9UPZ3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
HPS5Q9UPZ3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
HPS5Q9UPZ3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
HPS5Q9UPZ3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
HPS5Q9UPZ3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
HPS5Q9UPZ3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
HPS5Q9UPZ3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
HPS5Q9UPZ3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
HPS5Q9UPZ3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
HPS5Q9UPZ3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
HPS5Q9UPZ3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
HPS5Q9UPZ3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
HPS5Q9UPZ3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
HPS5Q9UPZ3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
HPS5Q9UPZ3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
HPS5Q9UPZ3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
HPS5Q9UPZ3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
HPS5Q9UPZ3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
HPS5Q9UPZ3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
HPS5Q9UPZ3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
HPS5Q9UPZ3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
HPS5Q9UPZ3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
HPS5Q9UPZ3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
HPS5Q9UPZ3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
HPS5Q9UPZ3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
HPS5Q9UPZ3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
HPS5Q9UPZ3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
HPS5Q9UPZ3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
HPS5Q9UPZ3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
HPS5Q9UPZ3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
HPS5Q9UPZ3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
HPS5Q9UPZ3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
HPS5Q9UPZ3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
HPS5Q9UPZ3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
HPS5Q9UPZ3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
HPS5Q9UPZ3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
HPS5Q9UPZ3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
HPS5Q9UPZ3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
HPS5Q9UPZ3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
HPS5Q9UPZ3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
HPS5Q9UPZ3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
HPS5Q9UPZ3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
HPS5Q9UPZ3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
HPS5Q9UPZ3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
HPS5Q9UPZ3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
HPS5Q9UPZ3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
HPS5Q9UPZ3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
HPS5Q9UPZ3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
HPS5Q9UPZ3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
HPS5Q9UPZ3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
HPS5Q9UPZ3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
HPS5Q9UPZ3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
HPS5Q9UPZ3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
HPS5Q9UPZ3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
HPS5Q9UPZ3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
HPS5Q9UPZ3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
HPS5Q9UPZ3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
HPS5Q9UPZ3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
HPS5Q9UPZ3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms