Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM21

MGAT4A, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase A, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT4AQ9UM21 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MGAT4AQ9UM21 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MGAT4AQ9UM21 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MGAT4AQ9UM21 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MGAT4AQ9UM21 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MGAT4AQ9UM21 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MGAT4AQ9UM21 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MGAT4AQ9UM21 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MGAT4AQ9UM21 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MGAT4AQ9UM21 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MGAT4AQ9UM21 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MGAT4AQ9UM21 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MGAT4AQ9UM21 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MGAT4AQ9UM21 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MGAT4AQ9UM21 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MGAT4AQ9UM21 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MGAT4AQ9UM21 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MGAT4AQ9UM21 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MGAT4AQ9UM21 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MGAT4AQ9UM21 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MGAT4AQ9UM21 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MGAT4AQ9UM21 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MGAT4AQ9UM21 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MGAT4AQ9UM21 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MGAT4AQ9UM21 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MGAT4AQ9UM21 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MGAT4AQ9UM21 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MGAT4AQ9UM21 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MGAT4AQ9UM21 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MGAT4AQ9UM21 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MGAT4AQ9UM21 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MGAT4AQ9UM21 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MGAT4AQ9UM21 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MGAT4AQ9UM21 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MGAT4AQ9UM21 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MGAT4AQ9UM21 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MGAT4AQ9UM21 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MGAT4AQ9UM21 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MGAT4AQ9UM21 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MGAT4AQ9UM21 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MGAT4AQ9UM21 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MGAT4AQ9UM21 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MGAT4AQ9UM21 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MGAT4AQ9UM21 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MGAT4AQ9UM21 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MGAT4AQ9UM21 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MGAT4AQ9UM21 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MGAT4AQ9UM21 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MGAT4AQ9UM21 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MGAT4AQ9UM21 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MGAT4AQ9UM21 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MGAT4AQ9UM21 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MGAT4AQ9UM21 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MGAT4AQ9UM21 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MGAT4AQ9UM21 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MGAT4AQ9UM21 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MGAT4AQ9UM21 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MGAT4AQ9UM21 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MGAT4AQ9UM21 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MGAT4AQ9UM21 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MGAT4AQ9UM21 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MGAT4AQ9UM21 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MGAT4AQ9UM21 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MGAT4AQ9UM21 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MGAT4AQ9UM21 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MGAT4AQ9UM21 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MGAT4AQ9UM21 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MGAT4AQ9UM21 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MGAT4AQ9UM21 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MGAT4AQ9UM21 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MGAT4AQ9UM21 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MGAT4AQ9UM21 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MGAT4AQ9UM21 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MGAT4AQ9UM21 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MGAT4AQ9UM21 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MGAT4AQ9UM21 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MGAT4AQ9UM21 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MGAT4AQ9UM21 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MGAT4AQ9UM21 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MGAT4AQ9UM21 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MGAT4AQ9UM21 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MGAT4AQ9UM21 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MGAT4AQ9UM21 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MGAT4AQ9UM21 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MGAT4AQ9UM21 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MGAT4AQ9UM21 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MGAT4AQ9UM21 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MGAT4AQ9UM21 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MGAT4AQ9UM21 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MGAT4AQ9UM21 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MGAT4AQ9UM21 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MGAT4AQ9UM21 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MGAT4AQ9UM21 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MGAT4AQ9UM21 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MGAT4AQ9UM21 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MGAT4AQ9UM21 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MGAT4AQ9UM21 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MGAT4AQ9UM21 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MGAT4AQ9UM21 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MGAT4AQ9UM21 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms