Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV8

CBLC, E3 ubiquitin-protein ligase CBL-C, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLCQ9ULV8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CBLCQ9ULV8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CBLCQ9ULV8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CBLCQ9ULV8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CBLCQ9ULV8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CBLCQ9ULV8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CBLCQ9ULV8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CBLCQ9ULV8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBLCQ9ULV8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBLCQ9ULV8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CBLCQ9ULV8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CBLCQ9ULV8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CBLCQ9ULV8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CBLCQ9ULV8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CBLCQ9ULV8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CBLCQ9ULV8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CBLCQ9ULV8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CBLCQ9ULV8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CBLCQ9ULV8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CBLCQ9ULV8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CBLCQ9ULV8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CBLCQ9ULV8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CBLCQ9ULV8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CBLCQ9ULV8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CBLCQ9ULV8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CBLCQ9ULV8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CBLCQ9ULV8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CBLCQ9ULV8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CBLCQ9ULV8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBLCQ9ULV8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBLCQ9ULV8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CBLCQ9ULV8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CBLCQ9ULV8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CBLCQ9ULV8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CBLCQ9ULV8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CBLCQ9ULV8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBLCQ9ULV8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CBLCQ9ULV8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CBLCQ9ULV8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBLCQ9ULV8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBLCQ9ULV8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBLCQ9ULV8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CBLCQ9ULV8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CBLCQ9ULV8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CBLCQ9ULV8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CBLCQ9ULV8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CBLCQ9ULV8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CBLCQ9ULV8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBLCQ9ULV8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBLCQ9ULV8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBLCQ9ULV8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBLCQ9ULV8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBLCQ9ULV8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CBLCQ9ULV8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBLCQ9ULV8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBLCQ9ULV8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBLCQ9ULV8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBLCQ9ULV8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBLCQ9ULV8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBLCQ9ULV8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBLCQ9ULV8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBLCQ9ULV8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBLCQ9ULV8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CBLCQ9ULV8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CBLCQ9ULV8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CBLCQ9ULV8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CBLCQ9ULV8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CBLCQ9ULV8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CBLCQ9ULV8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CBLCQ9ULV8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CBLCQ9ULV8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CBLCQ9ULV8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBLCQ9ULV8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBLCQ9ULV8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBLCQ9ULV8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBLCQ9ULV8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CBLCQ9ULV8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBLCQ9ULV8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBLCQ9ULV8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBLCQ9ULV8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CBLCQ9ULV8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CBLCQ9ULV8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBLCQ9ULV8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBLCQ9ULV8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CBLCQ9ULV8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CBLCQ9ULV8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CBLCQ9ULV8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CBLCQ9ULV8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CBLCQ9ULV8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CBLCQ9ULV8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBLCQ9ULV8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBLCQ9ULV8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBLCQ9ULV8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBLCQ9ULV8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBLCQ9ULV8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CBLCQ9ULV8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CBLCQ9ULV8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CBLCQ9ULV8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CBLCQ9ULV8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CBLCQ9ULV8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms