Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKB1

FBXW11, F-box/WD repeat-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW11Q9UKB1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FBXW11Q9UKB1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FBXW11Q9UKB1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FBXW11Q9UKB1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FBXW11Q9UKB1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
FBXW11Q9UKB1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FBXW11Q9UKB1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FBXW11Q9UKB1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FBXW11Q9UKB1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FBXW11Q9UKB1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FBXW11Q9UKB1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FBXW11Q9UKB1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FBXW11Q9UKB1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FBXW11Q9UKB1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FBXW11Q9UKB1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FBXW11Q9UKB1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
FBXW11Q9UKB1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FBXW11Q9UKB1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FBXW11Q9UKB1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FBXW11Q9UKB1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FBXW11Q9UKB1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FBXW11Q9UKB1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FBXW11Q9UKB1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FBXW11Q9UKB1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FBXW11Q9UKB1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FBXW11Q9UKB1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FBXW11Q9UKB1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FBXW11Q9UKB1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FBXW11Q9UKB1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FBXW11Q9UKB1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FBXW11Q9UKB1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FBXW11Q9UKB1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FBXW11Q9UKB1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FBXW11Q9UKB1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FBXW11Q9UKB1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
FBXW11Q9UKB1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FBXW11Q9UKB1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FBXW11Q9UKB1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FBXW11Q9UKB1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FBXW11Q9UKB1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FBXW11Q9UKB1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FBXW11Q9UKB1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
FBXW11Q9UKB1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
FBXW11Q9UKB1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FBXW11Q9UKB1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FBXW11Q9UKB1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
FBXW11Q9UKB1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FBXW11Q9UKB1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FBXW11Q9UKB1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FBXW11Q9UKB1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FBXW11Q9UKB1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FBXW11Q9UKB1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FBXW11Q9UKB1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
FBXW11Q9UKB1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FBXW11Q9UKB1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FBXW11Q9UKB1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FBXW11Q9UKB1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FBXW11Q9UKB1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FBXW11Q9UKB1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FBXW11Q9UKB1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FBXW11Q9UKB1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FBXW11Q9UKB1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FBXW11Q9UKB1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FBXW11Q9UKB1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FBXW11Q9UKB1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FBXW11Q9UKB1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FBXW11Q9UKB1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FBXW11Q9UKB1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FBXW11Q9UKB1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
FBXW11Q9UKB1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FBXW11Q9UKB1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FBXW11Q9UKB1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FBXW11Q9UKB1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
FBXW11Q9UKB1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FBXW11Q9UKB1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FBXW11Q9UKB1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FBXW11Q9UKB1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
FBXW11Q9UKB1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.54■■■□□ 2
FBXW11Q9UKB1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
FBXW11Q9UKB1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
FBXW11Q9UKB1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FBXW11Q9UKB1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FBXW11Q9UKB1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FBXW11Q9UKB1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FBXW11Q9UKB1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
FBXW11Q9UKB1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FBXW11Q9UKB1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FBXW11Q9UKB1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FBXW11Q9UKB1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FBXW11Q9UKB1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FBXW11Q9UKB1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FBXW11Q9UKB1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FBXW11Q9UKB1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FBXW11Q9UKB1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FBXW11Q9UKB1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FBXW11Q9UKB1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FBXW11Q9UKB1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FBXW11Q9UKB1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FBXW11Q9UKB1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FBXW11Q9UKB1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms