Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ68

MSRA, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRAQ9UJ68 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MSRAQ9UJ68 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MSRAQ9UJ68 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MSRAQ9UJ68 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MSRAQ9UJ68 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MSRAQ9UJ68 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MSRAQ9UJ68 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
MSRAQ9UJ68 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MSRAQ9UJ68 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MSRAQ9UJ68 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MSRAQ9UJ68 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MSRAQ9UJ68 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MSRAQ9UJ68 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MSRAQ9UJ68 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MSRAQ9UJ68 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
MSRAQ9UJ68 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MSRAQ9UJ68 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MSRAQ9UJ68 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MSRAQ9UJ68 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MSRAQ9UJ68 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MSRAQ9UJ68 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MSRAQ9UJ68 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MSRAQ9UJ68 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
MSRAQ9UJ68 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MSRAQ9UJ68 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MSRAQ9UJ68 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MSRAQ9UJ68 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MSRAQ9UJ68 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MSRAQ9UJ68 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MSRAQ9UJ68 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
MSRAQ9UJ68 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MSRAQ9UJ68 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MSRAQ9UJ68 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MSRAQ9UJ68 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MSRAQ9UJ68 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MSRAQ9UJ68 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MSRAQ9UJ68 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MSRAQ9UJ68 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MSRAQ9UJ68 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MSRAQ9UJ68 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MSRAQ9UJ68 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
MSRAQ9UJ68 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
MSRAQ9UJ68 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MSRAQ9UJ68 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MSRAQ9UJ68 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MSRAQ9UJ68 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MSRAQ9UJ68 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MSRAQ9UJ68 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
MSRAQ9UJ68 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MSRAQ9UJ68 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MSRAQ9UJ68 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MSRAQ9UJ68 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
MSRAQ9UJ68 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MSRAQ9UJ68 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MSRAQ9UJ68 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MSRAQ9UJ68 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MSRAQ9UJ68 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MSRAQ9UJ68 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MSRAQ9UJ68 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
MSRAQ9UJ68 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MSRAQ9UJ68 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MSRAQ9UJ68 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MSRAQ9UJ68 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MSRAQ9UJ68 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MSRAQ9UJ68 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MSRAQ9UJ68 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
MSRAQ9UJ68 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MSRAQ9UJ68 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
MSRAQ9UJ68 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MSRAQ9UJ68 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MSRAQ9UJ68 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MSRAQ9UJ68 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MSRAQ9UJ68 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MSRAQ9UJ68 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MSRAQ9UJ68 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MSRAQ9UJ68 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MSRAQ9UJ68 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MSRAQ9UJ68 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MSRAQ9UJ68 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MSRAQ9UJ68 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MSRAQ9UJ68 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MSRAQ9UJ68 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MSRAQ9UJ68 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
MSRAQ9UJ68 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MSRAQ9UJ68 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MSRAQ9UJ68 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
MSRAQ9UJ68 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MSRAQ9UJ68 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MSRAQ9UJ68 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MSRAQ9UJ68 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MSRAQ9UJ68 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MSRAQ9UJ68 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MSRAQ9UJ68 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MSRAQ9UJ68 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MSRAQ9UJ68 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MSRAQ9UJ68 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
MSRAQ9UJ68 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MSRAQ9UJ68 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MSRAQ9UJ68 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MSRAQ9UJ68 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms