Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
DDX20Q9UHI6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
DDX20Q9UHI6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
DDX20Q9UHI6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
DDX20Q9UHI6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
DDX20Q9UHI6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
DDX20Q9UHI6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
DDX20Q9UHI6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
DDX20Q9UHI6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
DDX20Q9UHI6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
DDX20Q9UHI6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
DDX20Q9UHI6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
DDX20Q9UHI6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
DDX20Q9UHI6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
DDX20Q9UHI6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
DDX20Q9UHI6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
DDX20Q9UHI6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DDX20Q9UHI6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
DDX20Q9UHI6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
DDX20Q9UHI6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
DDX20Q9UHI6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
DDX20Q9UHI6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
DDX20Q9UHI6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
DDX20Q9UHI6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
DDX20Q9UHI6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
DDX20Q9UHI6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
DDX20Q9UHI6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
DDX20Q9UHI6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
DDX20Q9UHI6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
DDX20Q9UHI6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
DDX20Q9UHI6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
DDX20Q9UHI6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
DDX20Q9UHI6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
DDX20Q9UHI6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
DDX20Q9UHI6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
DDX20Q9UHI6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DDX20Q9UHI6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DDX20Q9UHI6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
DDX20Q9UHI6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DDX20Q9UHI6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
DDX20Q9UHI6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
DDX20Q9UHI6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
DDX20Q9UHI6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
DDX20Q9UHI6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
DDX20Q9UHI6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
DDX20Q9UHI6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
DDX20Q9UHI6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
DDX20Q9UHI6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
DDX20Q9UHI6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
DDX20Q9UHI6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
DDX20Q9UHI6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
DDX20Q9UHI6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
DDX20Q9UHI6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
DDX20Q9UHI6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
DDX20Q9UHI6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
DDX20Q9UHI6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
DDX20Q9UHI6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
DDX20Q9UHI6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
DDX20Q9UHI6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DDX20Q9UHI6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DDX20Q9UHI6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
DDX20Q9UHI6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
DDX20Q9UHI6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DDX20Q9UHI6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
DDX20Q9UHI6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
DDX20Q9UHI6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DDX20Q9UHI6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
DDX20Q9UHI6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DDX20Q9UHI6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DDX20Q9UHI6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DDX20Q9UHI6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DDX20Q9UHI6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DDX20Q9UHI6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DDX20Q9UHI6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DDX20Q9UHI6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
DDX20Q9UHI6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
DDX20Q9UHI6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DDX20Q9UHI6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
DDX20Q9UHI6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
DDX20Q9UHI6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
DDX20Q9UHI6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
DDX20Q9UHI6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
DDX20Q9UHI6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DDX20Q9UHI6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DDX20Q9UHI6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DDX20Q9UHI6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
DDX20Q9UHI6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
DDX20Q9UHI6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
DDX20Q9UHI6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
DDX20Q9UHI6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
DDX20Q9UHI6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
DDX20Q9UHI6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
DDX20Q9UHI6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DDX20Q9UHI6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
DDX20Q9UHI6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DDX20Q9UHI6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DDX20Q9UHI6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DDX20Q9UHI6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DDX20Q9UHI6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
DDX20Q9UHI6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms