Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU0

TCF20, Transcription factor 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF20Q9UGU0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TCF20Q9UGU0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TCF20Q9UGU0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TCF20Q9UGU0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TCF20Q9UGU0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TCF20Q9UGU0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TCF20Q9UGU0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TCF20Q9UGU0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TCF20Q9UGU0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TCF20Q9UGU0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCF20Q9UGU0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCF20Q9UGU0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCF20Q9UGU0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCF20Q9UGU0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TCF20Q9UGU0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TCF20Q9UGU0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TCF20Q9UGU0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TCF20Q9UGU0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TCF20Q9UGU0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TCF20Q9UGU0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TCF20Q9UGU0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TCF20Q9UGU0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TCF20Q9UGU0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TCF20Q9UGU0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
TCF20Q9UGU0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TCF20Q9UGU0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TCF20Q9UGU0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TCF20Q9UGU0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TCF20Q9UGU0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TCF20Q9UGU0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TCF20Q9UGU0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TCF20Q9UGU0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TCF20Q9UGU0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TCF20Q9UGU0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TCF20Q9UGU0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TCF20Q9UGU0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TCF20Q9UGU0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TCF20Q9UGU0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TCF20Q9UGU0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
TCF20Q9UGU0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TCF20Q9UGU0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TCF20Q9UGU0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TCF20Q9UGU0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TCF20Q9UGU0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TCF20Q9UGU0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TCF20Q9UGU0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TCF20Q9UGU0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TCF20Q9UGU0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TCF20Q9UGU0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TCF20Q9UGU0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TCF20Q9UGU0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TCF20Q9UGU0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TCF20Q9UGU0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TCF20Q9UGU0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TCF20Q9UGU0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TCF20Q9UGU0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TCF20Q9UGU0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TCF20Q9UGU0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TCF20Q9UGU0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TCF20Q9UGU0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TCF20Q9UGU0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TCF20Q9UGU0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TCF20Q9UGU0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TCF20Q9UGU0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TCF20Q9UGU0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TCF20Q9UGU0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TCF20Q9UGU0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TCF20Q9UGU0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TCF20Q9UGU0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TCF20Q9UGU0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TCF20Q9UGU0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TCF20Q9UGU0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TCF20Q9UGU0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TCF20Q9UGU0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TCF20Q9UGU0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TCF20Q9UGU0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TCF20Q9UGU0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TCF20Q9UGU0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TCF20Q9UGU0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TCF20Q9UGU0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TCF20Q9UGU0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TCF20Q9UGU0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TCF20Q9UGU0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TCF20Q9UGU0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TCF20Q9UGU0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TCF20Q9UGU0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TCF20Q9UGU0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TCF20Q9UGU0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TCF20Q9UGU0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TCF20Q9UGU0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TCF20Q9UGU0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TCF20Q9UGU0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TCF20Q9UGU0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TCF20Q9UGU0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TCF20Q9UGU0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TCF20Q9UGU0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TCF20Q9UGU0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TCF20Q9UGU0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TCF20Q9UGU0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TCF20Q9UGU0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms