Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.55■■■■■ 5.36
CC2D2AQ9P2K1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC48.54■■■■■ 5.36
CC2D2AQ9P2K1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC48.54■■■■■ 5.36
CC2D2AQ9P2K1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.53■■■■■ 5.36
CC2D2AQ9P2K1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC48.52■■■■■ 5.36
CC2D2AQ9P2K1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC48.5■■■■■ 5.36
CC2D2AQ9P2K1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.5■■■■■ 5.36
CC2D2AQ9P2K1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC48.49■■■■■ 5.35
CC2D2AQ9P2K1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC48.47■■■■■ 5.35
CC2D2AQ9P2K1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC48.46■■■■■ 5.35
CC2D2AQ9P2K1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC48.46■■■■■ 5.35
CC2D2AQ9P2K1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC48.45■■■■■ 5.35
CC2D2AQ9P2K1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC48.45■■■■■ 5.35
CC2D2AQ9P2K1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.42■■■■■ 5.34
CC2D2AQ9P2K1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.42■■■■■ 5.34
CC2D2AQ9P2K1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.41■■■■■ 5.34
CC2D2AQ9P2K1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC48.41■■■■■ 5.34
CC2D2AQ9P2K1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC48.4■■■■■ 5.34
CC2D2AQ9P2K1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC48.39■■■■■ 5.34
CC2D2AQ9P2K1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.39■■■■■ 5.34
CC2D2AQ9P2K1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC48.39■■■■■ 5.34
CC2D2AQ9P2K1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC48.38■■■■■ 5.34
CC2D2AQ9P2K1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC48.37■■■■■ 5.33
CC2D2AQ9P2K1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.35■■■■■ 5.33
CC2D2AQ9P2K1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.33■■■■■ 5.33
CC2D2AQ9P2K1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC48.32■■■■■ 5.33
CC2D2AQ9P2K1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.32■■■■■ 5.33
CC2D2AQ9P2K1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC48.32■■■■■ 5.33
CC2D2AQ9P2K1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.3■■■■■ 5.32
CC2D2AQ9P2K1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC48.3■■■■■ 5.32
CC2D2AQ9P2K1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC48.29■■■■■ 5.32
CC2D2AQ9P2K1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC48.28■■■■■ 5.32
CC2D2AQ9P2K1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC48.28■■■■■ 5.32
CC2D2AQ9P2K1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC48.25■■■■■ 5.32
CC2D2AQ9P2K1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC48.25■■■■■ 5.32
CC2D2AQ9P2K1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC48.25■■■■■ 5.31
CC2D2AQ9P2K1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC48.24■■■■■ 5.31
CC2D2AQ9P2K1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC48.24■■■■■ 5.31
CC2D2AQ9P2K1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC48.23■■■■■ 5.31
CC2D2AQ9P2K1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.23■■■■■ 5.31
CC2D2AQ9P2K1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC48.22■■■■■ 5.31
CC2D2AQ9P2K1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC48.22■■■■■ 5.31
CC2D2AQ9P2K1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC48.22■■■■■ 5.31
CC2D2AQ9P2K1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.21■■■■■ 5.31
CC2D2AQ9P2K1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC48.21■■■■■ 5.31
CC2D2AQ9P2K1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC48.21■■■■■ 5.31
CC2D2AQ9P2K1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC48.2■■■■■ 5.31
CC2D2AQ9P2K1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.2■■■■■ 5.31
CC2D2AQ9P2K1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC48.2■■■■■ 5.31
CC2D2AQ9P2K1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.2■■■■■ 5.31
CC2D2AQ9P2K1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC48.19■■■■■ 5.31
CC2D2AQ9P2K1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC48.17■■■■■ 5.3
CC2D2AQ9P2K1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.17■■■■■ 5.3
CC2D2AQ9P2K1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.16■■■■■ 5.3
CC2D2AQ9P2K1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC48.15■■■■■ 5.3
CC2D2AQ9P2K1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC48.11■■■■■ 5.29
CC2D2AQ9P2K1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC48.11■■■■■ 5.29
CC2D2AQ9P2K1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.11■■■■■ 5.29
CC2D2AQ9P2K1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC48.1■■■■■ 5.29
CC2D2AQ9P2K1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.1■■■■■ 5.29
CC2D2AQ9P2K1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC48.1■■■■■ 5.29
CC2D2AQ9P2K1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC48.1■■■■■ 5.29
CC2D2AQ9P2K1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.09■■■■■ 5.29
CC2D2AQ9P2K1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC48.08■■■■■ 5.29
CC2D2AQ9P2K1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.07■■■■■ 5.29
CC2D2AQ9P2K1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.07■■■■■ 5.29
CC2D2AQ9P2K1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.07■■■■■ 5.29
CC2D2AQ9P2K1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC48.07■■■■■ 5.29
CC2D2AQ9P2K1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.06■■■■■ 5.28
CC2D2AQ9P2K1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC48.06■■■■■ 5.28
CC2D2AQ9P2K1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC48.05■■■■■ 5.28
CC2D2AQ9P2K1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC48.04■■■■■ 5.28
CC2D2AQ9P2K1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC48.04■■■■■ 5.28
CC2D2AQ9P2K1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC48.03■■■■■ 5.28
CC2D2AQ9P2K1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC48.02■■■■■ 5.28
CC2D2AQ9P2K1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC48.02■■■■■ 5.28
CC2D2AQ9P2K1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC48.01■■■■■ 5.28
CC2D2AQ9P2K1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC48■■■■■ 5.27
CC2D2AQ9P2K1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.99■■■■■ 5.27
CC2D2AQ9P2K1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.99■■■■■ 5.27
CC2D2AQ9P2K1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.99■■■■■ 5.27
CC2D2AQ9P2K1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC47.98■■■■■ 5.27
CC2D2AQ9P2K1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.98■■■■■ 5.27
CC2D2AQ9P2K1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC47.98■■■■■ 5.27
CC2D2AQ9P2K1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC47.97■■■■■ 5.27
CC2D2AQ9P2K1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC47.96■■■■■ 5.27
CC2D2AQ9P2K1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC47.96■■■■■ 5.27
CC2D2AQ9P2K1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC47.95■■■■■ 5.27
CC2D2AQ9P2K1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC47.95■■■■■ 5.27
CC2D2AQ9P2K1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.94■■■■■ 5.26
CC2D2AQ9P2K1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.92■■■■■ 5.26
CC2D2AQ9P2K1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC47.92■■■■■ 5.26
CC2D2AQ9P2K1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.9■■■■■ 5.26
CC2D2AQ9P2K1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC47.9■■■■■ 5.26
CC2D2AQ9P2K1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.89■■■■■ 5.26
CC2D2AQ9P2K1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC47.89■■■■■ 5.26
CC2D2AQ9P2K1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.89■■■■■ 5.26
CC2D2AQ9P2K1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC47.88■■■■■ 5.25
CC2D2AQ9P2K1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.88■■■■■ 5.25
CC2D2AQ9P2K1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.86■■■■■ 5.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms