Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR2

LRP1B, Low-density lipoprotein receptor-related protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 4,599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1BQ9NZR2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRP1BQ9NZR2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRP1BQ9NZR2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LRP1BQ9NZR2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRP1BQ9NZR2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRP1BQ9NZR2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRP1BQ9NZR2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRP1BQ9NZR2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRP1BQ9NZR2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRP1BQ9NZR2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRP1BQ9NZR2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRP1BQ9NZR2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.29
LRP1BQ9NZR2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
LRP1BQ9NZR2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRP1BQ9NZR2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRP1BQ9NZR2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRP1BQ9NZR2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRP1BQ9NZR2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LRP1BQ9NZR2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LRP1BQ9NZR2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LRP1BQ9NZR2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LRP1BQ9NZR2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LRP1BQ9NZR2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LRP1BQ9NZR2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRP1BQ9NZR2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRP1BQ9NZR2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRP1BQ9NZR2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
LRP1BQ9NZR2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRP1BQ9NZR2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRP1BQ9NZR2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRP1BQ9NZR2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRP1BQ9NZR2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRP1BQ9NZR2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRP1BQ9NZR2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRP1BQ9NZR2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRP1BQ9NZR2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRP1BQ9NZR2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRP1BQ9NZR2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRP1BQ9NZR2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRP1BQ9NZR2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LRP1BQ9NZR2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRP1BQ9NZR2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRP1BQ9NZR2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRP1BQ9NZR2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRP1BQ9NZR2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRP1BQ9NZR2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LRP1BQ9NZR2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRP1BQ9NZR2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRP1BQ9NZR2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LRP1BQ9NZR2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRP1BQ9NZR2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRP1BQ9NZR2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRP1BQ9NZR2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRP1BQ9NZR2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRP1BQ9NZR2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRP1BQ9NZR2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRP1BQ9NZR2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRP1BQ9NZR2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRP1BQ9NZR2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRP1BQ9NZR2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRP1BQ9NZR2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRP1BQ9NZR2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LRP1BQ9NZR2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRP1BQ9NZR2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRP1BQ9NZR2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRP1BQ9NZR2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRP1BQ9NZR2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRP1BQ9NZR2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRP1BQ9NZR2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRP1BQ9NZR2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRP1BQ9NZR2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRP1BQ9NZR2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRP1BQ9NZR2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRP1BQ9NZR2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LRP1BQ9NZR2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRP1BQ9NZR2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LRP1BQ9NZR2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRP1BQ9NZR2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRP1BQ9NZR2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRP1BQ9NZR2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRP1BQ9NZR2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LRP1BQ9NZR2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRP1BQ9NZR2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRP1BQ9NZR2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRP1BQ9NZR2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRP1BQ9NZR2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRP1BQ9NZR2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRP1BQ9NZR2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRP1BQ9NZR2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRP1BQ9NZR2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRP1BQ9NZR2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LRP1BQ9NZR2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRP1BQ9NZR2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRP1BQ9NZR2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRP1BQ9NZR2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRP1BQ9NZR2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LRP1BQ9NZR2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRP1BQ9NZR2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRP1BQ9NZR2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRP1BQ9NZR2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms