Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY65

TUBA8, Tubulin alpha-8 chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA8Q9NY65 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBA8Q9NY65 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBA8Q9NY65 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBA8Q9NY65 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBA8Q9NY65 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBA8Q9NY65 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBA8Q9NY65 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBA8Q9NY65 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBA8Q9NY65 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBA8Q9NY65 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBA8Q9NY65 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBA8Q9NY65 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBA8Q9NY65 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBA8Q9NY65 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBA8Q9NY65 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBA8Q9NY65 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBA8Q9NY65 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBA8Q9NY65 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBA8Q9NY65 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBA8Q9NY65 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBA8Q9NY65 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBA8Q9NY65 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBA8Q9NY65 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBA8Q9NY65 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBA8Q9NY65 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBA8Q9NY65 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBA8Q9NY65 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBA8Q9NY65 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBA8Q9NY65 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBA8Q9NY65 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBA8Q9NY65 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBA8Q9NY65 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBA8Q9NY65 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBA8Q9NY65 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBA8Q9NY65 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBA8Q9NY65 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBA8Q9NY65 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBA8Q9NY65 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBA8Q9NY65 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBA8Q9NY65 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBA8Q9NY65 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBA8Q9NY65 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBA8Q9NY65 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBA8Q9NY65 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBA8Q9NY65 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBA8Q9NY65 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBA8Q9NY65 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBA8Q9NY65 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBA8Q9NY65 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBA8Q9NY65 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBA8Q9NY65 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBA8Q9NY65 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBA8Q9NY65 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBA8Q9NY65 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBA8Q9NY65 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBA8Q9NY65 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBA8Q9NY65 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBA8Q9NY65 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBA8Q9NY65 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBA8Q9NY65 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBA8Q9NY65 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBA8Q9NY65 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBA8Q9NY65 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBA8Q9NY65 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBA8Q9NY65 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBA8Q9NY65 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBA8Q9NY65 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBA8Q9NY65 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBA8Q9NY65 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBA8Q9NY65 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TUBA8Q9NY65 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TUBA8Q9NY65 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBA8Q9NY65 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBA8Q9NY65 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBA8Q9NY65 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBA8Q9NY65 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBA8Q9NY65 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBA8Q9NY65 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBA8Q9NY65 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBA8Q9NY65 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBA8Q9NY65 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBA8Q9NY65 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBA8Q9NY65 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBA8Q9NY65 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBA8Q9NY65 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBA8Q9NY65 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBA8Q9NY65 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBA8Q9NY65 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBA8Q9NY65 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBA8Q9NY65 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBA8Q9NY65 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBA8Q9NY65 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBA8Q9NY65 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBA8Q9NY65 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBA8Q9NY65 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBA8Q9NY65 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBA8Q9NY65 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBA8Q9NY65 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBA8Q9NY65 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBA8Q9NY65 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms