Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ34

TMEM9B, Transmembrane protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM9BQ9NQ34 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM9BQ9NQ34 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM9BQ9NQ34 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM9BQ9NQ34 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM9BQ9NQ34 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM9BQ9NQ34 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM9BQ9NQ34 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM9BQ9NQ34 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM9BQ9NQ34 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM9BQ9NQ34 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM9BQ9NQ34 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM9BQ9NQ34 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM9BQ9NQ34 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM9BQ9NQ34 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM9BQ9NQ34 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM9BQ9NQ34 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM9BQ9NQ34 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM9BQ9NQ34 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM9BQ9NQ34 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM9BQ9NQ34 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM9BQ9NQ34 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM9BQ9NQ34 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM9BQ9NQ34 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM9BQ9NQ34 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM9BQ9NQ34 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM9BQ9NQ34 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM9BQ9NQ34 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM9BQ9NQ34 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM9BQ9NQ34 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM9BQ9NQ34 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM9BQ9NQ34 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM9BQ9NQ34 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM9BQ9NQ34 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM9BQ9NQ34 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM9BQ9NQ34 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM9BQ9NQ34 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM9BQ9NQ34 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM9BQ9NQ34 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM9BQ9NQ34 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM9BQ9NQ34 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM9BQ9NQ34 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM9BQ9NQ34 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM9BQ9NQ34 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM9BQ9NQ34 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM9BQ9NQ34 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM9BQ9NQ34 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM9BQ9NQ34 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM9BQ9NQ34 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM9BQ9NQ34 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM9BQ9NQ34 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM9BQ9NQ34 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM9BQ9NQ34 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM9BQ9NQ34 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM9BQ9NQ34 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM9BQ9NQ34 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM9BQ9NQ34 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM9BQ9NQ34 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM9BQ9NQ34 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM9BQ9NQ34 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM9BQ9NQ34 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM9BQ9NQ34 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM9BQ9NQ34 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM9BQ9NQ34 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM9BQ9NQ34 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM9BQ9NQ34 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM9BQ9NQ34 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM9BQ9NQ34 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM9BQ9NQ34 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM9BQ9NQ34 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM9BQ9NQ34 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM9BQ9NQ34 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM9BQ9NQ34 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM9BQ9NQ34 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM9BQ9NQ34 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM9BQ9NQ34 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMEM9BQ9NQ34 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM9BQ9NQ34 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM9BQ9NQ34 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM9BQ9NQ34 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM9BQ9NQ34 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM9BQ9NQ34 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM9BQ9NQ34 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM9BQ9NQ34 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM9BQ9NQ34 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM9BQ9NQ34 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM9BQ9NQ34 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM9BQ9NQ34 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM9BQ9NQ34 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM9BQ9NQ34 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM9BQ9NQ34 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM9BQ9NQ34 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM9BQ9NQ34 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM9BQ9NQ34 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM9BQ9NQ34 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM9BQ9NQ34 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM9BQ9NQ34 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM9BQ9NQ34 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM9BQ9NQ34 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM9BQ9NQ34 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM9BQ9NQ34 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms