Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TIMMDC1Q9NPL8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TIMMDC1Q9NPL8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TIMMDC1Q9NPL8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TIMMDC1Q9NPL8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TIMMDC1Q9NPL8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TIMMDC1Q9NPL8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TIMMDC1Q9NPL8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TIMMDC1Q9NPL8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TIMMDC1Q9NPL8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TIMMDC1Q9NPL8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TIMMDC1Q9NPL8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TIMMDC1Q9NPL8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TIMMDC1Q9NPL8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TIMMDC1Q9NPL8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TIMMDC1Q9NPL8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TIMMDC1Q9NPL8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TIMMDC1Q9NPL8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TIMMDC1Q9NPL8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TIMMDC1Q9NPL8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TIMMDC1Q9NPL8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TIMMDC1Q9NPL8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TIMMDC1Q9NPL8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TIMMDC1Q9NPL8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TIMMDC1Q9NPL8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TIMMDC1Q9NPL8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TIMMDC1Q9NPL8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TIMMDC1Q9NPL8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TIMMDC1Q9NPL8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TIMMDC1Q9NPL8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TIMMDC1Q9NPL8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TIMMDC1Q9NPL8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TIMMDC1Q9NPL8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TIMMDC1Q9NPL8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TIMMDC1Q9NPL8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TIMMDC1Q9NPL8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TIMMDC1Q9NPL8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TIMMDC1Q9NPL8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TIMMDC1Q9NPL8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TIMMDC1Q9NPL8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TIMMDC1Q9NPL8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TIMMDC1Q9NPL8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TIMMDC1Q9NPL8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TIMMDC1Q9NPL8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TIMMDC1Q9NPL8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TIMMDC1Q9NPL8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TIMMDC1Q9NPL8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TIMMDC1Q9NPL8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TIMMDC1Q9NPL8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TIMMDC1Q9NPL8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TIMMDC1Q9NPL8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TIMMDC1Q9NPL8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TIMMDC1Q9NPL8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TIMMDC1Q9NPL8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TIMMDC1Q9NPL8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TIMMDC1Q9NPL8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TIMMDC1Q9NPL8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TIMMDC1Q9NPL8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TIMMDC1Q9NPL8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TIMMDC1Q9NPL8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TIMMDC1Q9NPL8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TIMMDC1Q9NPL8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TIMMDC1Q9NPL8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TIMMDC1Q9NPL8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TIMMDC1Q9NPL8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TIMMDC1Q9NPL8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TIMMDC1Q9NPL8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TIMMDC1Q9NPL8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TIMMDC1Q9NPL8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TIMMDC1Q9NPL8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TIMMDC1Q9NPL8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TIMMDC1Q9NPL8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TIMMDC1Q9NPL8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TIMMDC1Q9NPL8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TIMMDC1Q9NPL8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TIMMDC1Q9NPL8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TIMMDC1Q9NPL8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TIMMDC1Q9NPL8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TIMMDC1Q9NPL8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TIMMDC1Q9NPL8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TIMMDC1Q9NPL8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TIMMDC1Q9NPL8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TIMMDC1Q9NPL8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TIMMDC1Q9NPL8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TIMMDC1Q9NPL8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TIMMDC1Q9NPL8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TIMMDC1Q9NPL8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TIMMDC1Q9NPL8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TIMMDC1Q9NPL8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TIMMDC1Q9NPL8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TIMMDC1Q9NPL8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms