Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP58

ABCB6, ATP-binding cassette sub-family B member 6, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB6Q9NP58 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ABCB6Q9NP58 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCB6Q9NP58 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCB6Q9NP58 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCB6Q9NP58 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCB6Q9NP58 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABCB6Q9NP58 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABCB6Q9NP58 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ABCB6Q9NP58 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ABCB6Q9NP58 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ABCB6Q9NP58 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ABCB6Q9NP58 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ABCB6Q9NP58 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ABCB6Q9NP58 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ABCB6Q9NP58 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ABCB6Q9NP58 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ABCB6Q9NP58 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ABCB6Q9NP58 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ABCB6Q9NP58 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ABCB6Q9NP58 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCB6Q9NP58 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCB6Q9NP58 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCB6Q9NP58 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCB6Q9NP58 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCB6Q9NP58 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCB6Q9NP58 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCB6Q9NP58 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCB6Q9NP58 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCB6Q9NP58 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCB6Q9NP58 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCB6Q9NP58 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCB6Q9NP58 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCB6Q9NP58 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCB6Q9NP58 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCB6Q9NP58 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCB6Q9NP58 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCB6Q9NP58 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCB6Q9NP58 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCB6Q9NP58 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCB6Q9NP58 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCB6Q9NP58 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCB6Q9NP58 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCB6Q9NP58 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCB6Q9NP58 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCB6Q9NP58 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCB6Q9NP58 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCB6Q9NP58 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCB6Q9NP58 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCB6Q9NP58 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCB6Q9NP58 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCB6Q9NP58 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCB6Q9NP58 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCB6Q9NP58 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCB6Q9NP58 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCB6Q9NP58 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCB6Q9NP58 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCB6Q9NP58 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCB6Q9NP58 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCB6Q9NP58 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCB6Q9NP58 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCB6Q9NP58 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCB6Q9NP58 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCB6Q9NP58 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCB6Q9NP58 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCB6Q9NP58 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCB6Q9NP58 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCB6Q9NP58 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCB6Q9NP58 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCB6Q9NP58 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCB6Q9NP58 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
ABCB6Q9NP58 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ABCB6Q9NP58 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ABCB6Q9NP58 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ABCB6Q9NP58 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ABCB6Q9NP58 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ABCB6Q9NP58 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ABCB6Q9NP58 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ABCB6Q9NP58 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCB6Q9NP58 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCB6Q9NP58 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCB6Q9NP58 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCB6Q9NP58 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCB6Q9NP58 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCB6Q9NP58 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCB6Q9NP58 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCB6Q9NP58 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCB6Q9NP58 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCB6Q9NP58 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCB6Q9NP58 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCB6Q9NP58 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCB6Q9NP58 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCB6Q9NP58 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCB6Q9NP58 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCB6Q9NP58 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCB6Q9NP58 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ABCB6Q9NP58 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ABCB6Q9NP58 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ABCB6Q9NP58 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ABCB6Q9NP58 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCB6Q9NP58 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms