Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Y6

POLR1B, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1BQ9H9Y6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR1BQ9H9Y6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR1BQ9H9Y6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR1BQ9H9Y6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR1BQ9H9Y6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR1BQ9H9Y6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR1BQ9H9Y6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR1BQ9H9Y6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR1BQ9H9Y6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR1BQ9H9Y6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR1BQ9H9Y6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR1BQ9H9Y6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR1BQ9H9Y6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR1BQ9H9Y6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR1BQ9H9Y6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR1BQ9H9Y6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR1BQ9H9Y6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR1BQ9H9Y6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR1BQ9H9Y6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR1BQ9H9Y6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR1BQ9H9Y6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLR1BQ9H9Y6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLR1BQ9H9Y6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR1BQ9H9Y6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR1BQ9H9Y6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR1BQ9H9Y6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR1BQ9H9Y6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR1BQ9H9Y6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR1BQ9H9Y6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR1BQ9H9Y6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR1BQ9H9Y6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR1BQ9H9Y6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR1BQ9H9Y6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR1BQ9H9Y6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR1BQ9H9Y6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR1BQ9H9Y6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR1BQ9H9Y6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR1BQ9H9Y6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR1BQ9H9Y6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR1BQ9H9Y6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR1BQ9H9Y6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR1BQ9H9Y6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR1BQ9H9Y6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR1BQ9H9Y6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR1BQ9H9Y6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR1BQ9H9Y6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR1BQ9H9Y6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR1BQ9H9Y6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR1BQ9H9Y6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR1BQ9H9Y6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR1BQ9H9Y6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR1BQ9H9Y6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR1BQ9H9Y6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR1BQ9H9Y6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR1BQ9H9Y6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR1BQ9H9Y6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR1BQ9H9Y6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR1BQ9H9Y6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR1BQ9H9Y6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR1BQ9H9Y6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR1BQ9H9Y6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR1BQ9H9Y6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR1BQ9H9Y6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR1BQ9H9Y6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR1BQ9H9Y6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR1BQ9H9Y6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR1BQ9H9Y6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR1BQ9H9Y6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR1BQ9H9Y6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR1BQ9H9Y6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR1BQ9H9Y6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR1BQ9H9Y6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR1BQ9H9Y6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR1BQ9H9Y6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR1BQ9H9Y6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR1BQ9H9Y6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR1BQ9H9Y6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR1BQ9H9Y6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR1BQ9H9Y6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR1BQ9H9Y6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR1BQ9H9Y6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR1BQ9H9Y6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR1BQ9H9Y6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR1BQ9H9Y6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR1BQ9H9Y6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR1BQ9H9Y6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR1BQ9H9Y6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR1BQ9H9Y6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR1BQ9H9Y6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR1BQ9H9Y6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR1BQ9H9Y6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR1BQ9H9Y6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR1BQ9H9Y6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR1BQ9H9Y6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR1BQ9H9Y6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR1BQ9H9Y6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR1BQ9H9Y6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR1BQ9H9Y6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR1BQ9H9Y6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR1BQ9H9Y6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms