Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B2

RPF2, Ribosome production factor 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPF2Q9H7B2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPF2Q9H7B2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RPF2Q9H7B2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPF2Q9H7B2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPF2Q9H7B2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPF2Q9H7B2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPF2Q9H7B2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPF2Q9H7B2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPF2Q9H7B2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPF2Q9H7B2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPF2Q9H7B2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPF2Q9H7B2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPF2Q9H7B2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPF2Q9H7B2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPF2Q9H7B2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RPF2Q9H7B2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPF2Q9H7B2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPF2Q9H7B2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPF2Q9H7B2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPF2Q9H7B2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPF2Q9H7B2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPF2Q9H7B2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RPF2Q9H7B2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPF2Q9H7B2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPF2Q9H7B2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RPF2Q9H7B2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPF2Q9H7B2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPF2Q9H7B2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPF2Q9H7B2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPF2Q9H7B2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPF2Q9H7B2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPF2Q9H7B2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPF2Q9H7B2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPF2Q9H7B2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPF2Q9H7B2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPF2Q9H7B2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
RPF2Q9H7B2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPF2Q9H7B2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPF2Q9H7B2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPF2Q9H7B2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPF2Q9H7B2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RPF2Q9H7B2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPF2Q9H7B2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPF2Q9H7B2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPF2Q9H7B2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPF2Q9H7B2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPF2Q9H7B2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPF2Q9H7B2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPF2Q9H7B2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPF2Q9H7B2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPF2Q9H7B2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPF2Q9H7B2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPF2Q9H7B2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPF2Q9H7B2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPF2Q9H7B2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPF2Q9H7B2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPF2Q9H7B2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPF2Q9H7B2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPF2Q9H7B2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPF2Q9H7B2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPF2Q9H7B2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RPF2Q9H7B2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPF2Q9H7B2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPF2Q9H7B2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RPF2Q9H7B2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPF2Q9H7B2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPF2Q9H7B2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPF2Q9H7B2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RPF2Q9H7B2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPF2Q9H7B2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPF2Q9H7B2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPF2Q9H7B2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPF2Q9H7B2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPF2Q9H7B2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPF2Q9H7B2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPF2Q9H7B2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPF2Q9H7B2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPF2Q9H7B2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPF2Q9H7B2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RPF2Q9H7B2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPF2Q9H7B2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPF2Q9H7B2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPF2Q9H7B2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPF2Q9H7B2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPF2Q9H7B2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPF2Q9H7B2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPF2Q9H7B2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPF2Q9H7B2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPF2Q9H7B2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPF2Q9H7B2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPF2Q9H7B2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPF2Q9H7B2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPF2Q9H7B2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPF2Q9H7B2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPF2Q9H7B2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPF2Q9H7B2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPF2Q9H7B2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RPF2Q9H7B2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RPF2Q9H7B2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPF2Q9H7B2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms