Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2E6

SEMA6A, Semaphorin-6A, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6AQ9H2E6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA6AQ9H2E6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA6AQ9H2E6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA6AQ9H2E6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA6AQ9H2E6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA6AQ9H2E6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA6AQ9H2E6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA6AQ9H2E6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA6AQ9H2E6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA6AQ9H2E6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA6AQ9H2E6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA6AQ9H2E6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA6AQ9H2E6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA6AQ9H2E6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA6AQ9H2E6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA6AQ9H2E6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA6AQ9H2E6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA6AQ9H2E6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA6AQ9H2E6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA6AQ9H2E6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA6AQ9H2E6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA6AQ9H2E6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA6AQ9H2E6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA6AQ9H2E6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA6AQ9H2E6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA6AQ9H2E6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA6AQ9H2E6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA6AQ9H2E6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA6AQ9H2E6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA6AQ9H2E6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA6AQ9H2E6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA6AQ9H2E6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA6AQ9H2E6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA6AQ9H2E6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA6AQ9H2E6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA6AQ9H2E6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA6AQ9H2E6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA6AQ9H2E6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA6AQ9H2E6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA6AQ9H2E6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA6AQ9H2E6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA6AQ9H2E6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA6AQ9H2E6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA6AQ9H2E6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA6AQ9H2E6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA6AQ9H2E6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA6AQ9H2E6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA6AQ9H2E6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA6AQ9H2E6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA6AQ9H2E6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA6AQ9H2E6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA6AQ9H2E6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA6AQ9H2E6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA6AQ9H2E6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA6AQ9H2E6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA6AQ9H2E6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA6AQ9H2E6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA6AQ9H2E6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA6AQ9H2E6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA6AQ9H2E6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA6AQ9H2E6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA6AQ9H2E6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA6AQ9H2E6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA6AQ9H2E6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA6AQ9H2E6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA6AQ9H2E6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA6AQ9H2E6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA6AQ9H2E6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA6AQ9H2E6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA6AQ9H2E6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA6AQ9H2E6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA6AQ9H2E6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA6AQ9H2E6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA6AQ9H2E6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA6AQ9H2E6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA6AQ9H2E6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA6AQ9H2E6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA6AQ9H2E6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA6AQ9H2E6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA6AQ9H2E6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA6AQ9H2E6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA6AQ9H2E6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA6AQ9H2E6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA6AQ9H2E6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA6AQ9H2E6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA6AQ9H2E6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA6AQ9H2E6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA6AQ9H2E6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA6AQ9H2E6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA6AQ9H2E6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA6AQ9H2E6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA6AQ9H2E6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA6AQ9H2E6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA6AQ9H2E6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA6AQ9H2E6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA6AQ9H2E6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA6AQ9H2E6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA6AQ9H2E6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA6AQ9H2E6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA6AQ9H2E6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms