Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2OQ9C0C9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
UBE2OQ9C0C9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
UBE2OQ9C0C9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
UBE2OQ9C0C9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
UBE2OQ9C0C9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
UBE2OQ9C0C9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
UBE2OQ9C0C9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
UBE2OQ9C0C9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
UBE2OQ9C0C9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
UBE2OQ9C0C9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
UBE2OQ9C0C9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
UBE2OQ9C0C9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
UBE2OQ9C0C9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
UBE2OQ9C0C9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
UBE2OQ9C0C9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
UBE2OQ9C0C9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
UBE2OQ9C0C9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
UBE2OQ9C0C9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
UBE2OQ9C0C9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
UBE2OQ9C0C9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
UBE2OQ9C0C9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
UBE2OQ9C0C9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
UBE2OQ9C0C9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
UBE2OQ9C0C9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
UBE2OQ9C0C9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
UBE2OQ9C0C9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
UBE2OQ9C0C9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
UBE2OQ9C0C9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
UBE2OQ9C0C9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
UBE2OQ9C0C9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
UBE2OQ9C0C9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
UBE2OQ9C0C9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
UBE2OQ9C0C9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
UBE2OQ9C0C9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
UBE2OQ9C0C9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
UBE2OQ9C0C9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
UBE2OQ9C0C9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
UBE2OQ9C0C9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
UBE2OQ9C0C9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
UBE2OQ9C0C9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
UBE2OQ9C0C9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
UBE2OQ9C0C9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
UBE2OQ9C0C9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
UBE2OQ9C0C9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
UBE2OQ9C0C9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
UBE2OQ9C0C9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
UBE2OQ9C0C9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
UBE2OQ9C0C9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
UBE2OQ9C0C9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
UBE2OQ9C0C9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
UBE2OQ9C0C9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
UBE2OQ9C0C9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
UBE2OQ9C0C9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
UBE2OQ9C0C9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
UBE2OQ9C0C9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
UBE2OQ9C0C9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
UBE2OQ9C0C9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
UBE2OQ9C0C9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
UBE2OQ9C0C9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
UBE2OQ9C0C9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
UBE2OQ9C0C9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
UBE2OQ9C0C9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
UBE2OQ9C0C9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
UBE2OQ9C0C9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
UBE2OQ9C0C9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
UBE2OQ9C0C9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
UBE2OQ9C0C9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
UBE2OQ9C0C9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
UBE2OQ9C0C9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
UBE2OQ9C0C9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
UBE2OQ9C0C9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
UBE2OQ9C0C9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
UBE2OQ9C0C9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
UBE2OQ9C0C9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
UBE2OQ9C0C9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
UBE2OQ9C0C9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
UBE2OQ9C0C9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
UBE2OQ9C0C9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
UBE2OQ9C0C9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
UBE2OQ9C0C9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
UBE2OQ9C0C9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
UBE2OQ9C0C9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
UBE2OQ9C0C9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
UBE2OQ9C0C9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
UBE2OQ9C0C9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
UBE2OQ9C0C9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
UBE2OQ9C0C9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
UBE2OQ9C0C9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
UBE2OQ9C0C9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
UBE2OQ9C0C9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
UBE2OQ9C0C9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
UBE2OQ9C0C9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
UBE2OQ9C0C9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
UBE2OQ9C0C9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UBE2OQ9C0C9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
UBE2OQ9C0C9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
UBE2OQ9C0C9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
UBE2OQ9C0C9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
UBE2OQ9C0C9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
UBE2OQ9C0C9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms