Protein–RNA interactions for Protein: Q9C098

DCLK3, Serine/threonine-protein kinase DCLK3, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK3Q9C098 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DCLK3Q9C098 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DCLK3Q9C098 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DCLK3Q9C098 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DCLK3Q9C098 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DCLK3Q9C098 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
DCLK3Q9C098 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
DCLK3Q9C098 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DCLK3Q9C098 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
DCLK3Q9C098 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DCLK3Q9C098 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
DCLK3Q9C098 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DCLK3Q9C098 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DCLK3Q9C098 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DCLK3Q9C098 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DCLK3Q9C098 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DCLK3Q9C098 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DCLK3Q9C098 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DCLK3Q9C098 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DCLK3Q9C098 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DCLK3Q9C098 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DCLK3Q9C098 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DCLK3Q9C098 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DCLK3Q9C098 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DCLK3Q9C098 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DCLK3Q9C098 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DCLK3Q9C098 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
DCLK3Q9C098 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DCLK3Q9C098 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DCLK3Q9C098 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DCLK3Q9C098 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DCLK3Q9C098 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DCLK3Q9C098 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DCLK3Q9C098 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DCLK3Q9C098 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DCLK3Q9C098 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DCLK3Q9C098 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DCLK3Q9C098 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DCLK3Q9C098 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
DCLK3Q9C098 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DCLK3Q9C098 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
DCLK3Q9C098 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DCLK3Q9C098 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DCLK3Q9C098 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DCLK3Q9C098 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DCLK3Q9C098 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
DCLK3Q9C098 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DCLK3Q9C098 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DCLK3Q9C098 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DCLK3Q9C098 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DCLK3Q9C098 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DCLK3Q9C098 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DCLK3Q9C098 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DCLK3Q9C098 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DCLK3Q9C098 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DCLK3Q9C098 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DCLK3Q9C098 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DCLK3Q9C098 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DCLK3Q9C098 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DCLK3Q9C098 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DCLK3Q9C098 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DCLK3Q9C098 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DCLK3Q9C098 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DCLK3Q9C098 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DCLK3Q9C098 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DCLK3Q9C098 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DCLK3Q9C098 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DCLK3Q9C098 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DCLK3Q9C098 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DCLK3Q9C098 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DCLK3Q9C098 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DCLK3Q9C098 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
DCLK3Q9C098 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DCLK3Q9C098 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DCLK3Q9C098 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
DCLK3Q9C098 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DCLK3Q9C098 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DCLK3Q9C098 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DCLK3Q9C098 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DCLK3Q9C098 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DCLK3Q9C098 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DCLK3Q9C098 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DCLK3Q9C098 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DCLK3Q9C098 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DCLK3Q9C098 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DCLK3Q9C098 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DCLK3Q9C098 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DCLK3Q9C098 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DCLK3Q9C098 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DCLK3Q9C098 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DCLK3Q9C098 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DCLK3Q9C098 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DCLK3Q9C098 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DCLK3Q9C098 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DCLK3Q9C098 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DCLK3Q9C098 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
DCLK3Q9C098 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DCLK3Q9C098 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DCLK3Q9C098 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DCLK3Q9C098 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms